Диагностика дмрв ваз 2110: Как проверить ДМРВ на ВАЗ 2110 своими руками: признаки неисправности, как промыть и почистить, замена

Содержание

• 1 Принцип работы
• 2 Основные неисправности
• 3 Способы проверки
  • 3.1 Отключение
  • 3.2 Проверка мультиметром
  • 3.3 Визуальная проверка
• 4 Инструкция по замене и установке
• 5 Видео «Замена ДМРВ на ВАЗ 2110»

[ Раскрыть]

[ Скрыть]

Принцип работы

Основной задачей ДМРВ, называемого еще расходометром, является подсчет нужного количества свежего воздуха, поступающего в цилиндры двигателя. Находится расходометр на ВАЗ 2110 в воздуховоде за воздушным фильтром, где он измеряет количество и температуру наружного воздуха.

Оптимальным соотношением между топливом и воздухом является 1:14. Если пропорции не отвечают необходимым параметрам, то происходит либо перерасход топлива, либо снижается мощность автомобиля. Датчик массового расхода воздуха контролирует, чтобы воздух поступал определенными порциями. Он подсчитывает, какое количество воздуха поступило и передает данную информацию ЭБУ. Учитывая эти показания компьютер рассчитывает нужный объем топлива.

При нажатии на педаль газа увеличивается количество поступающего воздуха, а соответственно расходуется больше топлива. Если авто движется равномерно порции воздуха и топлива, поступающие в цилиндры силового агрегата, на каждом цикле одинаковые. Если водитель газует, открывается дроссельная заслонка и объем поступающего воздуха увеличивается, а вместе с этим увеличивается нагрузка на двигатель. Если педаль газа отпущена, нагрузка падает.

Основные неисправности

ДМРВ редко выходит из строя и требует ремонта, но важно знать, какие признаки его неисправности:

1. Увеличивается расход топлива. Это можно определить по бортовому компьютеру. При неисправности расходомера расход топлива увеличивается на литр и более.
2. Снижается мощность автомобиля.
3. Неравномерная работа силового агрегата. Автомобиль либо медленно разгоняется, либо слишком быстро набирает скорость.
4. Мотор не заводится или заводится не с первого раза.
5. Плавают холостые обороты.

Перечисленные признаки не обязательно свидетельствуют о поломке расходомера, причины могут быть в неисправности других устройств, что потребует их ремонта. Поэтому необходимо проверить исправность расходомера.

Способы проверки

Существует несколько способов, как проверить ДМРВ своими руками.

Отключение

Одним из способов проверки расходомера является его отключение. Для этого необходимо извлечь разъем, с помощью которого подключается датчик массового расхода воздуха к системе ВАЗ 2110.

В этом случае включается аварийный режим, расчет количества необходимого воздуха выполняется по положению дроссельной заслонки. Если с отключенным датчиком автомобиль движется динамичнее, то требуется его замена или ремонт, возможно, что поможет чистка.

Проверка мультиметром

Для проверки нужен мультиметр и знания по ремонту и как обращаться с тестером. Измерительный прибор нужно поставить в режим замера постоянного давления, обозначаемого буквой V или DCV.

Для понимания работы датчика массового расхода воздуха нужно знать его распиновку:

• провод розового или красно-черного цвета ведет к центральному блоку;
• провод зеленого цвета – заземление;
• провод бело-серого цвета предназначен для выхода напряжения;
• желтый провод служит для подачи тока на вход сигнала.

Разобравшись с проводами, можно приступать к тестированию:

1. Сначала нужно включить мультиметр, выставить на нем напряжение 20 В, провода с электродами установить в соответствующие разъемы.
2. Для удобства подключения рекомендуется воспользоваться двумя булавками. Их нужно вставить в отверстия, с каких выходят зеленый и желтый провода, и присоединить к ним электроды тестера.
3. Теперь нужно включить зажигание и измерить напряжение. На новом датчике напряжение составляет 0,9-1,0 В.

Со временем напряжение увеличивается, так как резисторы изнашиваются, сопротивление падает.

Чем больше показания напряжения, тем выше износ прибора:

• хорошее состояние – 1,01-1,02 В;
• нормальное состояние — 1,02-1,03 В;
• устройство скоро перестанет функционировать – 1,0-1,04 В;
• скорую смерть означают показания напряжения 1,04-1,05 В;
• замена устройства необходима, если показания 1,05 и выше.

Выяснить напряжение ДМРВ можно с помощью бортового компьютера. Для этого необходимо зайти в раздел «напряжение с ДМРВ», мы должны найти показатель «U ДМРВ».

Визуальная проверка

Для визуальной проверки следует осмотреть гофру и ДМРВ. Если обнаружены следы конденсата или смазки, они могут вызвать неисправность прибора. Иногда чистка от грязи помогает восстановить работоспособность устройства и избежать ремонта. Грязь скапливается из-за редкой замены воздушного фильтра.

Пятна смазки появляются, если засорился маслобойник или в картере уровень масла превышает допустимый, может быть признаком неисправности датчика массового расхода воздуха. Если причина в загрязнениях, то все элементы нужно промыть или почистить (автор видео — Алексей Романов).

После чистки приступаем к визуальному осмотру самого датчика. На расходомере впереди установлено резиновое уплотнительное кольцо, которое служит для герметизации: оно препятствует проникновению нефильтрованного воздуха через входное отверстие.

Если кольцо сдвинулось или осталось на фильтре, то на сеточке может накопиться пыль. Такое загрязнение вполне может быть причиной неисправности чувствительного элемента.

Инструкция по замене и установке

Если чистка элементов системы не помогла и причина неисправностей в поломке ДМРВ, его можно заменить своими руками.

Процедура замены ДМРВ на ВАЗ 2110 своими руками состоит из этапов:

1. В первую очередь нужно заглушить двигатель и извлечь ключ зажигания.
2. Далее извлекаем разъем расходомера.
3. Открутив винты крепления хомутов, нужно отсоединить шланг впускной трубы, которая присоединена к корпусу воздушного фильтра.

   Отсоединенный шланг впускной трубы

4. Далее извлекаем датчик массового расхода воздуха. Перед тем как установить новый расходник, следует почистить или промыть его посадочное место.
5. Сборка осуществляется в обратном порядке.

На этом замена расходомера на ВАЗ 2110 своими руками окончена. Можно проверять работу двигателя, проехав небольшое расстояние.

 Загрузка …

Видео «Замена ДМРВ на ВАЗ 2110»

В этом видео демонстрируется, как заменить ДМРВ на ВАЗ 2110 инжектор (автор канал «В гараже у Сандро»).

Была ли эта статья полезна?

Спасибо за Ваше мнение!

Статья была полезнаПожалуйста, поделитесь информацией с друзьями

Да (100.00%)

Нет

Признаки неисправности ДМРВ на ВАЗ 2110: как их проверить правильно?

Автомобильный рынок не стоит на месте, производители постоянно улучшают показатели мощности двигателей машин, расхода топлива, аэродинамических значений, придумывают варианты изменения общей комфортабельности. Основным и явным улучшением стал переход от применения карбюраторного способа питания к более эффективной инжекторной системе.

Как работает последняя? Регулирует количественную подачу топлива согласно разовой дозировки для функционирования силовой установки в разных форматах деятельности. Это позволяет уменьшить объем потребления воздуха и обеспечить максимальную выдачу мощности силовой конструкции.

Однако механики утверждают, что устройство карбюраторной системы технологически проще, ведь карбюратор работает от механики, а значит, можно предположить высокую надежность механизма. Такой системой оснащен ВАЗ-2110. Преимущество устройства – топливовоздушная масса образовывается в карбюраторе и в цилиндрах путем разрежения, которое создается с помощью поршней.

Читайте также: Что делать, если на ВАЗ-2110 перестал работать стеклоподъемник

Технический вариант инжекторной системы сложнее. Рабочая смесь появляется в цилиндрических изделиях, а подача ее составляющих реализуется отдельно друг от друга.

Нужный объем топлива обеспечивается за счет электронного блока управления, но ему необходимо обозначить несколько важных характеристик:

• как располагается коленчатый вал;
• какова скорость вращения;
• сколько воздуха поступает в цилиндры;
• какой его объем содержится в отработанном газе;
• где находится дроссельная заслонка.

За эти данные и расчет нужного топлива отвечают датчики, зафиксированные в отдельных компонентах силового изделия – ДМРВ, которые мы рассмотрим подробнее прямо сейчас.

Виды датчиков массового расхода воздуха

Датчик, предоставляющий возможность определить объем поступившего воздуха, мы рассмотрим на примере ваз 2110. В ВАЗ-2110, как и в других машинах, устройство находится внутри воздушного патрубка, около фильтра, и отвечает за фиксацию потока воздуха, приходящегося на выход с фильтра.

ДМРВ постоянно усовершенствуют, сегодня существует несколько измерителей, высчитывающих потребленный воздух:

1. В качестве главного компонента выступает трубка Пито. Зафиксированная в датчике пластинка меняет положение под действием потока воздуха. Угол уклона пластины измеряется потенциометром, в свою очередь меняющим сопротивление. Это служит сигналом для блока управления чтобы определить объем поступившего воздуха.
2. Массовый выпуск современных устройств ДМРВ предполагает наличие в датчиках термоанемометрических измеряющих механизмов. В теплообменнике стоят сразу 2 тонкие пластины, сделанные из платины. После подачи на пластины энергии для их прогревания одна из них остается рабочей, а вторая – контрольной. Датчик ДМРВ в этой конструкции позволяет обеспечить неизменную одинаковую температуру, касающуюся 2-х пластин.
3. Рабочие элементы пленочного измерителя представляют собой кремниевые пластины, на которых присутствует платиновое напыление.

Какими бывают неисправности ДМРВ в ВАЗ-2110

Показатели ДМРВ определяют правильное смесеформирование топливовоздушной массы в ВАЗ-2110. Неисправности и неточности в слаженной работе всех компонентов единой системы датчика провоцируют возникновение неполадок в работе устройства, также бывает невозможным запустить в автомобиле мотор.

Читайте также: Почему не горят фонари заднего вида на ВАЗ-2110

Неисправный датчик имеет следующие признаки, в которых необходимо разобраться для последующего устранения поломки:

1. Загорается сигнал Check engine.
2. Увеличивается количество используемого бензина.
3. Падает мощность.
4. Снижается возможность набирать скорость.
5. Сложно или совсем невозможно запустить механизм.
6. Обороты имеют плавающий характер с форматом холостого хода.

Это – основные признаки неисправности устройства ДМРВ ВАЗ-2110. Но, по словам автомехаников, причины поломки могут скрываться и в других деталях автомобиля. Чтобы не потратить время впустую и не чинить исправное, желательно сначала установить точную поломку, сделать это можно своими руками.

Как проверить состояние ДМРВ в ВАЗ-2110

Чтобы проверка ДМРВ в ВАЗ-2110 показала правильный результат, специалисты рекомендуют воспользоваться одним из нижеперечисленных способов:

1. Сначала следует отсоединить разъем устройства и завести двигатель ВАЗ-2110. После отключения датчика контроллер начинает работать в аварийном формате и, ориентируясь на положение дроссельной заслонки, подготавливает топливную массу. Что касается оборотов двигателя во время проверки состояния ДМРВ в ВАЗ-2110, их число не должно превышать установленные 1500 оборотов за минуту. Теперь сядьте за руль автомобиля и попробуйте поехать. Если кажется, что машина стала ездить резвее, значит, ваши предположения подтвердились – ДМРВ действительно неисправный.
2. Если штатную прошивку ранее заменили на какую-то другую, понять, что в ней находится во время аварийного характера работы, крайне сложно. В этом случае продвиньте под упор заслонки пластину, толщина которой близится к 1 мм. Обороты сразу поднимутся. Теперь достаньте фишку с датчика. Если двигатель продолжает работать, все дело в прошивке датчика, если быть еще точнее, то в шагах РХХ при аварийном варианте без ДМРВ.
3. Внешний осмотр включает откручивание хомута гофра воздухозаборника на выходе механизма. Стащите ее и осмотрите внутреннюю конструкцию датчика и гофра. В идеале они должны быть сухими и чистыми, наличие конденсата и масляного раствора – недопустимые признаки.

При отсутствии регулярной замены воздушного фильтра чувствительный компонент датчика часто выходит из строя, поэтому следите за своевременной установкой детали. Что касается масла, возможно, его слишком много в картере двигателя или забит маслоотбойник, встроенный в вентиляцию.

Проверка исправности ДМРВ мультиметром

Проверить расход воздуха в ВАЗ-2110 можно и с помощью мультиметра. Этот способ хорошо подходит, если в автомобиле установлен датчик фирмы Bosch с номерами 0280218004, 0280218037, 0280218116.

Каждый кабель в устройстве датчика ВАЗ-2110 обеспечивает отдельные функции:

• желтый – обозначает вход сигнала в установку;
• серо-белый – выводит напряжение питания из механизма;
• зеленый – определяет выход заземления;
• розовый с черным – осуществляет подход к главному реле.

Заметьте, что цвета проводов могут меняться, но выводы остаются прежними. Для лучшего понимания ДМРВ в ВАЗ-2110 ниже представлена схема датчика.

Пошаговая инструкция по проверке ДМРВ в ВАЗ-2110 мультиметром выглядит так:

1. Включите зажигание, но двигатель не заводите.
2. Подключите мультиметр красным проводом к желтому, черным к зеленому, воспользовавшись щупом. Эта процедура позволяет определить напряжение, возникшее между выводами.
3. Чем хорош щуп, он внедряется через уплотнители из резины вдоль проводков, не нарушая целостности изолирующего материала. Применение иголок считается некорректным, погрешность в измерениях может оказаться большой.
4. Далее снимите с мультиметра показания.

Читайте также: Снятие радиатора охлаждения на ВАЗ-2110

Напряжение на выходе нового устройства варьируется в пределах от 0,996 до 1,01 Вольт. Во время эксплуатации значения могут меняться, в основном увеличиваться. Больший показатель напряжения говорит о большей степени износа ДМРВ:

• от 1,01 до 1,02 – датчик полностью исправный;
• от 1,02 до 1,03 – состояние не плохое;
• от 1,04 до 1,04 – скоро измеритель воздуха придется менять;
• от 1,04 до 1,05 – состояние критическое, эксплуатация возможна, если не заявлен ни один негативный симптом;
• более 1,05 – датчик на ВАЗ-2110 пора заменить незамедлительно.

Признаки неисправности ДМРВ ВАЗ 2110: чистка, ремонт и проверка датчика массового расхода воздуха » Авто центр ру

Оптимальная работа силового агрегата в «Десятке» зависит от многих параметров и характеристик, в частности, от качества топливовоздушной смеси. Для отслеживания правильного отношения при формировании горючей смеси используется в ВАЗ 2110 ДМРВ — датчик массового расхода воздуха. Подробнее о том, что это за устройство, как произвести его диагностику и замену, вы сможете узнать из этого материала.

[ Скрыть]

Принцип работы

Что такое ДМРВ и в чем заключается его принцип действия? Сразу же скажем — путать датчик массового расхода воздуха с контроллером температуры наружного воздуха нельзя, поскольку это два совершенно разных устройства. Первостепенное предназначение расходомера заключается в подсчете необходимого объема воздушного потока, который поступает в цилиндры мотора. Этот воздух является одной из составляющих при образовании топливовоздушной смеси. Сам ДМРВ в «Десятке» располагается за воздушным фильтрующим элементом.

Чтобы двигатель работал в нормальном режиме, при формировании горючей смеси должны четко соблюдаться соотношения веществ — 1:14. В том случае, если эти пропорции не соблюдается, то работа мотора будет некорректной, что в итоге приведет к перерасходу бензина или понижению динамики и мощности транспортного средства. Благодаря расходомеру воздушный поток передается в цилиндры мотора определенными порциями. Данные о подсчете объема воздушного потока, поступившего в двигатель, поступают на электронный блок управления. В соответствии с полученными данными, ЭБУ вычисляет необходимый объем топлива.

Когда водитель жмет на педаль газа, значительно возрастает объем подающегося воздушного потока, соответственно, это приводит к увеличению расхода бензина. В том случае, если транспортное средство передвигается равномерно, то порции горючего и воздушного потока, которые попадают в цилиндры, также будут одинаковыми на каждом цикле. При нажатии на педаль газа происходит открытие дросселя, что в итоге приводит к увеличению подающегося воздуха, а это также способствует и увеличению нагрузки на силовой агрегат.

Возможные неисправности и способы их устранения

Теперь рассмотрим основные признаки неисправности, которые позволят определить поломку расходомера:

1. Повышенный расход бензина. В данном случае неполадку можно выявить по показаниям бортового компьютера, если последний вычисляет объем топлива. Если ДМРВ ломается, то расход бензина может возрасти на один литр или больше.
2. Понижение мощности двигателя по время работы.
3. Мотор автомобиля стал работать менее стабильно. Машине требуется больше времени для разгона, а иногда двигатель нехарактерно быстро набирает скорость.
4. Силовой агрегат «Десятки» не запускается либо запускается, но не сразу, через несколько попыток.
5. Плавающие холостые обороты.

Разумеется, таким симптомы неполадок могут быть связаны и с другими неисправностями, к примеру, свечей, трамблера и других компонентов системы зажигания. Поэтому для того, чтобы точно убедиться в неработоспособности расходомера, придется произвести проверку устройства. Что касается способов устранения неполадок, то сам ДМРВ обычно не подлежит ремонту, поэтому в большинстве случаев при неполадках в его работе устройство просто меняется. Бывает такое, что причины обусловлены плохим контактом девайса с бортовой сетью авто, поэтому перед заменой рекомендуем проверить цепь подключения, а также качество контакта устройства с разъемом.

Методы проверки датчика на работоспособность

Как проверить расходомер своими руками? Есть несколько вариантов диагностики, предлагаем ознакомиться с каждым из них (автор видео — канал Бездельник TV).

Отключение

Для начала нужно попробовать отключить расходомер от питания. Чтобы сделать это, нужно завести двигатель и дать ему поработать какое-то время. Далее, от расходомера нужно будет отсоединить штекер — после этого должен активировать аварийный режим работы мотора. В данном случае расчет объема нужного воздушного потока будет осуществляться в соответствии с положением дроссельной заслонки. Если после отключения вы заметили, что двигатель стал работать более правильно и при этом он стал более динамичным, то однозначно ДМРВ подлежит замене.

Диагностика с помощью мультиметра

Диагностика может быть выполнена с помощью мультиметра, для этого рекомендуем ознакомиться с инструкцией по эксплуатации тестера. Прибор необходимо настроить в режим измерения постоянного напряжения, обычно он маркируется символами DCV либо V.

Чтобы подключение устройства не вызвало сложностей, необходимо точно знать распиновку девайса:

• черно-красный или розовый контакт — это подключение к управляющему модулю;
• зеленый — это земля (заземление, масса), подсоединяется к кузову или АКБ;
• серо-белый контакт — выходное напряжение;
• желтый — используется для подачи тока на вход.

Диагностика мультиметром выполняется так:

1. Для начала тестер следует включить и установить на нем значение напряжения в 20 вольт, а затем щупы от прибора подсоединяются в соответствующим контактам на штекере.
2. Чтобы подключение было более удобным, можно использовать булавки, потребуется две штуки. Каждая из них устанавливается в отверстие с зеленым и желтым контактам. Затем к этим булавкам надо будет подключить щупы прибора.
3. Следующим этапом будет активация зажигания и измерение напряжения. Подробнее о результатах тестирования читайте ниже (автор видео — канал IZO)))LENTA).

На работоспособном девайса уровень напряжения составит в районе 1.01-1.04. Если показания составляют от 1.02 до 1.05 вольт, это говорит о том, что в скором будущем устройство надо будет поменять. Если же полученные показания выше, то расходомер подлежит замене, поскольку он вышел из строя.

Нужно отметить, что в ходе эксплуатации параметр напряжения будет только расти, поскольку изнашиваются резисторные компоненты устройства, а величина сопротивления, соответственно, снижается. Точно определить напряжение можно также с помощью бортового компьютера, если в нем есть соответствующая функция. Для поиска следует зайти в раздел напряжения расходомера и найти значение U.

Визуальный осмотр

Что касается визуальной диагностики, то в первую очередь необходимо проверить состояние гофры, в которой установлен расходомер, а также само устройство. Если в результате проверки вы увидели следы моторной жидкости или конденсата, то не исключено, что девайс не работает именно по этой причине. В некоторых случаях чистка устройства от загрязнений позволяет возобновить работу расходомера и предотвратить возможную замену. В разгар праздника закончились спиртные напитки и ночь за окном? Мы берем это на себя! И доставка алкоголя в Новосибирске больше не станет для Вас проблемой! Ведь наш бар на колёсах или если хотите — Авто-бар, привезёт бутылочку-другую в течении каких-нибудь 20-30 минут в любую точку города! Нужно учитывать, что загрязнения обычно скапливаются в результате редкой замены воздушного фильтрующего элемента (автор видео о неисправности регулятора — канал В гараже у Сандро).

Если же вы заметили следы моторной жидкости, то есть вероятность, что причина кроется в засорении салобойника, также проблема может заключаться в превышении допустимого уровня смазки в картере. Когда очистка будет завершена, необходимо будет произвести визуальный осмотр регулятора — на передней его части вы можете увидеть уплотнительную резинку, которая используется для герметизации. Уплотнитель необходим для предотвращения неочищенного воздушного потока и может быть такое, что резинка немного сдвинулась — это приведет к скоплению пыли на сетке расходомера.

Инструкция по замене и установке своими руками

Как произвести замену регулятора в гаражных условиях:

1. Для начала следует отключить двигатель и зажигание.
2. Далее, откройте капот и найдите место установки ДМРВ. От регулятора нужно отсоединить штекер с проводкой.
3. После этого выкрутите болты, которые фиксируют хомуты, и затем отсоедините патрубок впускной магистрали. Эта магистраль подсоединена к корпусу воздушного фильтра.
4. Выполнив эти действия, необходимо демонтировать расходомер из места установки. Прежде чем произвести монтаж нового ДМРВ, необходимо очистить или промыть место установки. Дальнейшая установка и сборка осуществляется в обратном порядке.

Фотогалерея «Меняем расходомер»

Особенности чистки регулятора

Как почистить регулятор путем промывки? В некоторых случаях очистка действительно помогает продлить срок службы расходомера, этот процесс можно назвать составляющей ремонта. Для очистки можно использовать специализированные средства, предназначенные для конкретно этой цели. Также можно применять и жидкость WD-40 либо средство для очистки карбюратора.

Как промыть расходомер своими руками:

1. Для начала необходимо демонтировать ДМРВ, подробнее об этом мы рассказали выше.
2. Когда устройство будет у вас в руках, при помощи очищающего средства нужно будет произвести промывку всех чувствительных компонентов регулятора. В частности, речь идет о проволочной сетке, термосенсоре, а также контактах. При очистке будете максимально внимательны и регулярно следите за уровнем давления струи из баллона. Учтите, что сама струя не должна быть слишком сильной, лучше всего держать баллон на расстоянии примерно 5-10 см от устройства.
3. Подождите несколько минут, после чего нанесите очистительное средство еще раз, опять немного подождите. Процедура очистки должна осуществляться несколько раз, но как показывает практика, обычно трех раз вполне достаточно для того, чтобы получить необходимый результат.
4.  Затем, в медицинский шприц необходимо залить дистиллят со спиртом (найти можно в любой аптеке). При помощи шприца обработайте все чувствительные компоненты устройства, а также контакты, это позволит их тщательно очистить.

Заключение

Поломка ДМРВ может стать причиной серьезных неполадок в работе автомобильного двигателя. Поэтому каждый автовладелец должен следить за работоспособностью и помнить о сроке службы расходомера. Если в работе ДМРВ появляются первые признаки неполадок, можно попробовать промыть устройство, обычно это помогает на ранней стадии загрязнения.

Видео «Особенности замены расходомера в гаражных условиях»

Как производится процедура замены и какие моменты при выполнении этой задачи следует учитывать — узнайте из ролика ниже (автор — канал В гараже у Сандро).

Шесть ассоциированных с макрофагами генов в синовиальной оболочке представляют собой новый диагностический признак остеоартрита

1. Чан С, Ли К, Джу Дж. Х. Последние обновления диагностики, патофизиологии и лечения остеоартрита коленного сустава. Int J Mol Sci (2021) 22(5):2619. дои: 10.3390/ijms22052619 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

2. Кац Ю.Н., Арант К.Р., Лозер Р.Ф. Диагностика и лечение остеоартрита тазобедренного и коленного суставов: обзор. ДЖАМА (2021) 325 (6): 568–78. дои: 10.1001/jama.2020.22171 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

3. Вуделл-Мэй Дж. Э., Зоммерфельд С. Д. Роль воспаления и иммунной системы в прогрессировании остеоартрита. J Orthop Res (2020) 38 (2): 253–7. doi: 10.1002/jor.24457 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

4. Robinson WH, Lepus CM, Wang Q, Raghu H, Mao R, Lindstrom TM и др. Воспаление низкой степени как ключевой медиатор патогенеза остеоартрита. Nat Rev Rheumatol (2016) 12 (10): 580–92. doi: 10.1038/nrreum.2016.136 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

5. Сакураи Ю., Фудзита М., Кавасаки С., Санаки Т., Йошиока Т., Хигасино К. и др.. Вклад синовиальных макрофагов в боль при запущенном остеоартрите крыс, устойчивую к ингибиторам циклооксигеназы. Боль (2019) 160 (4): 895–907. дои: 10.1097/j.pain.0000000000001466 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

6. Мэтиссен А., Конаган П.Г. Синовит при остеоартрите: современное понимание с терапевтическими последствиями. Артрит Res Ther (2017) 19 (1): 18. дои: 10.1186/s13075-017-1229-9 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

7. Сюэ М.Ф., Чжан С., Веллман С.С., Болоньези М.П., ​​Краус В.Б. Синергическая роль макрофагов и нейтрофилов в прогрессировании остеоартрита. Ревматоидный артрит (2021) 73 (1): 89–99. дои: 10.1002/арт.41486 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

8. Molnar V, Matisic V, Kodvanj I, Bjelica R, Jelec Z, Hudetz D и др. Цитокины и хемокины, участвующие в патогенезе остеоартрита. Int J Mol Sci (2021) 22(17):9208. дои: 10.3390/ijms22179208 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

9. Лопес Э.Б.П., Филиберти А., Хусейн С.А., Хамфри М.Б. Иммунный вклад в остеоартроз. Curr Osteoporos Rep (2017) 15 (6): 593–600. doi: 10.1007/s11914-017-0411-y [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

10. Фернандес Т.Л., Гомолл А.Х., Латтерманн С., Эрнандес А.Дж., Буэно Д.Ф., Амано МТ. Макрофаг: потенциальная мишень для регенерации хряща. Фронт Иммунол (2020) 11:111. doi: 10.3389/fimmu.2020.00111 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

11. Томсон А., Хилкенс CMU. Синовиальные макрофаги при остеоартрите: ключ к пониманию патогенеза? Фронт Иммунол (2021) 12:678757. дои: 10.3389/fimmu.2021.678757 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

12. Ohashi Y, Uchida K, Fukushima K, Satoh M, Koyama T, Tsuchiya M и др. Корреляция между экспрессией CD163 и болью в покое у пациентов с остеоартритом тазобедренного сустава: возможный вклад CD163+ моноцитов/макрофагов в патогенез боли. J Orthop Res (2022) 40 (6): 1365–74. doi: 10.1002/jor.25157 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

13. Wang D, Chai XQ, Hu SS, Pan F. Суставные синовиальные макрофаги как потенциальная мишень для внутрисуставного лечения боли, связанной с остеоартритом. Остеоартритный хрящ (2022) 30 (3): 406–15. doi: 10.1016/j.joca.2021.11.014 [PubMed] [CrossRef] [Академия Google]

14. Ohashi Y, Uchida K, Fukushima K, Satoh M, Koyama T, Tsuchiya M, et al. Экспрессия и повышение NGF у пациентов с остеоартритом тазобедренного сустава с болью и центральной сенсибилизацией. BioMed Res Int (2021) 2021:9212585. дои: 10.1155/2021/9212585 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

15. Васконселос Д.П., Джабангве С., Ламгари М., Алвес С.Дж. Нейроиммунное взаимодействие при боли в суставах: роль макрофагов. Фронт Иммунол (2022) 13:812962. doi: 10.3389/fimmu.2022.812962 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

16. Cheng H, Hao B, Sun J, Yin M. C-терминальные сшитые телопептиды коллагена II типа в качестве биомаркера радиологического остеоартрита коленного сустава: метаанализ. Хрящ (2020) 11 (4): 512–20. дои: 10.1177/1947603518798884 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

17. Seco-Calvo J, Sanchez-Herraez S, Casis L, Valdivia A, Perez-Urzelai I, Gil J, et al. Активность пептидазы синовиальной жидкости как биомаркер клинического прогрессирования остеоартрита коленного сустава. Костяной сустав Res (2020) 9(11): 789–97. дои: 10.1302/2046-3758.911.BJR-2020-0022.R2 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

18. Zhao X, Zhao Y, Sun X, Xing Y, Wang X, Yang Q. Иммуномодуляция МСК и внеклеточных везикул, полученных из МСК, при остеоартрите. Front Bioeng Biotechnol (2020) 8: 575057. doi: 10.3389/fbioe.2020.575057 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

19. Чароентонг П., Финотелло Ф., Ангелова М., Майер С., Ефремова М., Ридер Д. и др.. Иммуногеномный анализ рака выявляет взаимосвязь генотип-иммунофенотип и предикторы ответа на блокаду контрольных точек. Cell Rep (2017) 18(1):248–62. doi: 10.1016/j.celrep.2016.12.019[PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

20. Li Z, Huang B, Yi W, Wang F, Wei S, Yan H и др.. Идентификация потенциальных ранних диагностических биомаркеров сепсиса. J Inflammation Res (2021) 14: 621–31. DOI: 10.2147/JIR.S298604 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

21. Yu B, Yin YX, Tang YP, Wei KL, Pan ZG, Li KZ и др. Диагностическая и прогностическая ценность генов, связанных с иммунной системой, при болезни Крона. Фронт Иммунол (2021) 12:643036. doi: 10.3389/fimmu.2021.643036 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

22. Мо С., Дай Л., Ван И, Сонг Б., Ян З., Гу В. Всесторонний анализ системных транскриптомных изменений и воспалительной реакции во время возникновения и прогрессирования COVID-19. Oxid Med Cell Longev (2021) 2021:9998697. дои: 10.1155/2021/9998697 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

23. Lu T, Liu Z, Guo D, Ma C, Duan L, He Y и др.. Рассечение внутричерепных аневризм на основе транскриптома раскрывает «иммуно-термическую» микросреду и определяет генную сигнатуру патологических признаков для оценки риска. Фронт Иммунол (2022) 13:878195. doi: 10.3389/fimmu.2022.878195 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

24. Глассон С.С., Бланше Т.Дж., Моррис Э. А. Хирургическая дестабилизация модели медиального мениска (DMM) остеоартрита у мыши 129/SvEv. Остеоартритный хрящ (2007) 15(9):1061–9. doi: 10.1016/j.joca.2007.03.006 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

25. Zhang H, Lin C, Zeng C, Wang Z, Wang H, Lu J и др.. Поляризация синовиальных макрофагов M1 усугубляет экспериментальный остеоартрит частично из-за r-спондина-2. Энн Реум Дис (2018) 77 (10): 1524–34. doi: 10.1136/annrheumdis-2018-213450 [PubMed] [CrossRef] [Академия Google]

26. Zhang H, Cai D, Bai X. Макрофаги регулируют прогрессирование остеоартрита. Хрящ остеоартрита (2020) 28 (5): 555–61. doi: 10.1016/j.joca.2020.01.007 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

27. Гриффин ТМ, Scanzello CR. Врожденное воспаление и синовиальные макрофаги в патофизиологии остеоартрита. Clin Exp Rheumatol (2019) 37 Suppl 120 (5): 57–63. doi:  10.3389/fimmune.2020.00111 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

28. Cao J, Ding H, Shang J, Ma L, Wang Q, Feng S. Анализ сети коэкспрессии взвешенных генов выявляет специфические модули и узловые гены, связанные с иммунной инфильтрацией остеоартрита. Энн Трансл Мед (2021) 9(20):1525. дои: 10.21037/атм-21-4566 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

29. Li S, Wang H, Zhang Y, Qiao R, Xia P, Kong Z и др. COL3A1 и MMP9 служат потенциальными диагностическими биомаркерами остеоартрита и связаны с инфильтрацией иммунных клеток. Фронт Жене (2021) 12: 721258. doi: 10.3389/fgene.2021.721258 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

30. Амос Н., Лаудер С., Эванс А., Фельдманн М., Бондесон Дж. Перенос гена аденовируса в синовиальные клетки остеоартрита с использованием эндогенного ингибитора IkappaBalpha показывает, что большинство, но не все, воспалительные и деструктивные медиаторы зависят от NFkappaB. Ревматол (Оксфорд) (2006) 45 (10): 1201–9. doi: 10.1093/ревматология/kel078 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

31. Wang T, He C. Провоспалительные цитокины: связь между ожирением и остеоартритом.

32. Menarim BC, Gillis KH, Oliver A, Ngo Y, Werre SR, Barrett SH и др.. Активация макрофагов в синовиальной оболочке здоровых и пораженных остеоартритом суставов лошадей. Front Vet Sci (2020) 7: 568756. дои: 10.3389/fvets.2020.568756 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

33. Кобаяши М., Кониси Х., Такай Т., Кияма Х. DAP12-зависимый сигнал способствует провоспалительной поляризации в микроглии после повреждения нерва и усугубляет дегенерацию поврежденных нейронов. Глия (2015) 63 (6): 1073–82. doi: 10.1002/glia.22802 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

34. Отеро К., Тернбулл И.Р., Полиани П.Л., Верми В., Черутти Э., Аоши Т. и др.. Колониестимулирующий фактор макрофагов индуцирует пролиферацию и выживание макрофагов через путь, включающий DAP12 и бета-катенин. Nat Immunol (2009) 10(7):734–43. дои: 10.1038/ni.

35. Ма Дж., Цзян Т., Тан Л., Ю Дж. Т. TYROBP при болезни Альцгеймера. Мол Нейробиол (2015) 51(2):820–6. doi: 10.1007/s12035-014-8811-9 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

36. Spahn JH, Li W, Bribriesco AC, Liu J, Shen H, Ibricevic A и др.. Экспрессия DAP12 в макрофагах легких опосредует ишемию/реперфузионное повреждение, способствуя экстравазации нейтрофилов. Дж Иммунол (2015) 194(8):4039–48. doi: 10.4049/jimmunol.1401415 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

37. Bosco MC, Pierobon D, Blengio F, Raggi F, Vanni C, Gattorno M, et al. Гипоксия модулирует профиль экспрессии генов иммунорегуляторных рецепторов в зрелых дендритных клетках человека: идентификация TREM-1 как нового маркера гипоксии

38. Клос А., Теннер А.Дж. , Йохсвич К.О., Агер Р.Р., Рейс Э.С., Коль Дж. Роль анафилатоксинов в здоровье и болезни. Мол Иммунол (2009) 46(14):2753–66. doi: 10.1016/j.molimm.2009.04.027 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

39. Lu W, Wang L, Yao J, Wo C, Chen Y. C5a усугубляет дисфункцию суставного хряща и синовиальной жидкости у крыс с иммобилизацией коленного сустава. Mol Med Rep (2018) 18(2):2110–6. дои: 10.3892/ммр.2018.9208 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

40. Олферьев М., Масуда Э., Танака С., Бланк М.С., Прикоп Л. Роль активирующего белка 1 в регуляции транскрипции промотора FCGR2B человека, опосредованной полиморфизмом -343 G -> c, связанным с системной красной волчанкой. J Biol Chem (2007) 282(3):1738–46. дои: 10.1074/jbc.M605808200 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

41. Смит К.Г., Клатворти М.Р. FcgammaRIIB при аутоиммунитете и инфекциях: эволюционное и терапевтическое значение. Nat Rev Immunol (2010) 10(5):328–43. дои: 10. 1038/nri2762 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

42. Wang Q, Runhaar J, Kloppenburg M, Boers M, Bijlsma JWJ, Bierma-Zeinstra SMA и др. Диагностика остеоартрита коленного сустава на ранней стадии на основе раннего клинического течения: данные когорты CHECK. Arthritis Res Ther (2021) 23 (1): 217. doi: 10.1186/s13075-021-02598-5 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

43. Хараден К.А., Хюбнер Дж.Л., Сюэ М.Ф., Ли Ю.Дж., Краус В.Б. Биомаркеры синовиальной жидкости, связанные с тяжестью остеоартрита, отражают воспаление, связанное с макрофагами и нейтрофилами. Артрит Рес Тер (2019) 21(1):146. doi: 10.1186/s13075-019-1923-x [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

44. Xiao Q, Li X, Li Y, Wu Z, Xu C, Chen Z и др. Биологическое лекарство и иммунотерапия, опосредованная доставкой лекарств. Acta Pharm Sin B (2021) 11 (4): 941–60. doi: 10.1016/j.apsb.2020.12.018 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

45. Steinle H, Weber J, Stoppelkamp S, Grosse-Berkenbusch K, Golombek S, Weber M, et al. Доставка синтетических мРНК для регенерации тканей. Рекламная доставка лекарств, версия (2021) 179:114007. doi: 10.1016/j.addr.2021.114007 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

46. Kim MK, Ha CW, In Y, Cho SD, Choi ES, Ha JK и др. Многоцентровое двойное слепое клиническое исследование фазы III для оценки эффективности и безопасности клеточной и генной терапии у пациентов с остеоартритом коленного сустава. Hum Gene Ther Clin Dev (2018) 29 (1): 48–59. doi: 10.1089/humc.2017.249 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

47. Lee H, Kim H, Seo J, Choi K, Lee Y, Park K и др.. TissueGene-c способствует противовоспалительной микросреде в крысиной модели остеоартрита с монойодоацетатом через поляризацию макрофагов М2, что приводит к облегчению боли и структурному улучшению. Инфламмофармакология (2020) 28(5):1237–52. doi: 10.1007/s10787-020-00738-y [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

48. Fidelix TS, Macedo CR, Maxwell LJ, Fernandes Moca Trevisani V. Диацереин для лечения остеоартрита. Cochrane Database Syst Rev (2014) 2):CD005117. дои: 10.1002/14651858.CD005117.pub3 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

49. Latourte A, Cherifi C, Maillet J, Ea HK, Bouaziz W, Funck-Brentano T и др. Системное ингибирование передачи сигналов IL-6/Stat3 защищает от экспериментального остеоартрита. Энн Реум Дис (2017) 76 (4): 748–55. doi: 10.1136/annrheumdis-2016-209757 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

50. Ding Y, Wang L, Zhao Q, Wu Z, Kong L. МикроРНК93 ингибирует апоптоз хондроцитов и воспаление при остеоартрите, воздействуя на сигнальный путь TLR4/NFkappaB. Int J Mol Med (2019) 43 (2): 779–90. doi: 10.3892/ijmm.2018.4033 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

51. Ji Y, Fang QY, Wang SN, Zhang ZW, Hou ZJ, Li JN и др. Lnc-РНК BLACAT1 регулирует дифференцировку стромальных стволовых клеток костного мозга путем нацеливания на миР-142-5p при остеоартрите. Eur Rev Med Pharmacol Sci (2020) 24 (6): 2893–901. doi: 10.26355/eurrev_202003_20653 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

Karchin Lab Университет Джона Хопкинса

Публикации

2022

Скотт С.К., Шао Х.М., Никнафс Н., Балан А., Перейра Г., Марроне К.А., Лам В.К., Мюррей Д.С., Фелисиано Д.Л., Леви Б.П., Эттингер Д.С., Ханн К.Л., Брамер Д.Р., Форде П.М., Карчин Р., Найду Дж., Анагносту В. (2022) Половые различия иммуногенных особенностей ответа на блокаду иммунных контрольных точек Front Oncol. 2022 авг;12:945798.

Shao XM, Huang J, Niknafs N, Balan A, Cherry C, White J, Velculescu VE, Anagnostou V, Karchin R. (2022) Бремя иммуногенных мутаций HLA класса II предсказывает ответ на блокаду иммунных контрольных точек Ann Oncol. 2022 июль; 33 (7): 728-738.

Чжэн Л., Никнафс Н., Вуд Л.Д., Карчин Р., Шарпф Р.Б. (2022)Оценка фракций раковых клеток и деревьев клонов на основе мультирегионального секвенирования опухолей. Биоинформатика. 2022 1 июня: btac367. doi: 10.1093/биоинформатика/btac367.

Гонг X, Карчин Р. (2022) Иммуногенность опухоли, опосредованная геном HLA, и уклонение от иммунитета Mol Cancer Res. 2022 г., 9 мая: molcanres.MCR-21-0886-A.2021.doi: 10.1158/1541-7786.MCR-21-0886.

2021

Форде П.М., Анагносту В., Сан З., Дальберг С.Е., Киндлер Х.Л., Никнафс Н., Перселл Т., Сантана-Давила Р., Дудек А.З., Боргаи Х., Ланис М., Белкейд З., Смит К.Н., Балан А., Уайт Дж.Р., Черри С., Ashok Sivakumar IK, Shao XM, Chan HY, Singh D, Thapa S, Illei PB, Pardoll DM, Karchin R, Velculescu VE, Brahmer JR, Ramalingam SS. (2021) Дурвалумаб с платимом-пеметрекседом при нерезектабельной мезотелиоме плевры: выживание, геномный и иммунологические анализы фазы 2 исследования PrE0505 Nat Med. ноябрь;27(11):1910-1920

Fujikura K, Hosoda W, Felsenstein M, Song Q, Reiter JG, Zheng L, Beleva Guthrie V, Rincon N, Dal Molin M, Dudley J, Cohen JD, Wang P, Fischer CG, Braxton AM, Noë M, Jongepier M, Фернандес-Дель Кастильо С. , Мино-Кенудсон М., Шмидт С.М., Ип-Шнайдер М.Т., Лоулор Р.Т., Сальвия Р., Робертс Н.Дж., Томпсон Э.Д., Карчин Р., Леннон А.М., Цзяо Ю., Вуд Л.Д. (2021) Мультирегиональное полноэкзомное секвенирование внутрипротоковых папиллярных муцинозных новообразований выявляет частые соматические мутации KLF4 преимущественно в низкосортных регионах. Кишка. Май;70(5):928-939

Макохон-Мур А.П., Липсон Э.Дж., Хупер Дж.Е., Цукер А., Хонг Дж., Бельски С.М., Хаяши А., Тохейм С., Баэз П., Каппагантула Р., Кохутек З., Макаров В., Риаз Н., Постоу М.А., Чепмен П.Б., Карчин Р., Socci ND, Solit DB, Chan TA, Taylor BS, Topalian SL, Iacobuzio-Donahue CA. (2021) Генетическая эволюция устойчивых к лечению кожных, акральных и увеальных меланом Clin Cancer Res. март 1:27(5):1516-1525

2020

Анагносту В., Брум Д.С., Никнафс Н., Уайт Дж.Р., Шао Х.М., Сидхом Дж.В., Стейн Дж., Цай Х.Л., Ван Х., Белкейд З., Мюррей Дж., Балан А., Феррейра Л., Росс-Макдональд П. , Винд-Ротоло М., Барас AS, Taube J, Karchin R, Scharpf RB, Grasso C, Ribas A, Pardoll DM, Topalian SL, Velculescu VE.. (2020)Мультиомный анализ опухолей и иммунных клеток предсказывает ответ на блокаду иммунных контрольных точек при меланоме Cell Rep Med . 17 ноября; 1(8):100139

Ноэ М., Никнафс Н., Фишер К.Г., Хакенг В.М., Белева Гатри В., Хосода В., Дебеляк М., Папп Э., Адлефф В., Уайт М.Р., Лукини С., Пи А., Скарпа А., Бутурини Г., Замбони Г., Кастелли П., Хонг SM, Yachida S, Hiraoka N, Gill AJ, Samra JS, Offerhaus GJA, Hoorens A, Verheij J, Jansen C, Adsay NV, Jiang W, Winter J, Albores-Saavedra J, Terris B, Thompson ED, Roberts NJ, Hruban RH, Karchin R, Scharpf RB, Brosens LAA, Velculescu VE, Wood LD. (2020)Геномная характеристика злокачественной прогрессии неопластических кист поджелудочной железы. Нац. Комм. 14 августа; 11 (1): 4085. дои: 10.1038/s41467-020-17917-8.

Пейгель К.А., Ким Р., Моад К., Басби Б., Чжэн Л., Тохейм С., Райан М., Карчин Р. (2020) Комплексный информационный анализ вариантов, связанных с раком. JCO CCI март 4:310-317. doi: 10.1200/CCI.19.00132.

Брнич С.Е., Абу Таюн А.Н., Коуч Ф.Дж., Каттинг Г.Р., Гринблатт М.С., Хайнен К.Д., Канави Д.М., Луо Х, МакНалти С.М., Старита Л.М., Тавтигян С.В., Райт М.В., Харрисон С.М., Бизекер Л.Г., Берг Д.С.; Рабочая группа по интерпретации вариантов последовательности ресурсов клинического генома. Рекомендации по применению критерия функционального доказательства PS3/BS3 с использованием структуры интерпретации вариантов последовательности ACMG/AMP. Геном Мед. 201931 декабря; 12(1):3. doi: 10.1186/s13073-019-0690-2.

Доувилль С., Коэн Дж.Д., Птак Дж., Пополи М., Шефер Дж., Силлиман Н., Доббин Л., Шон Р.Э., Ти Дж., Гиббс П., Гоггинс М., Вольфганг С.Л., Ван Т.Л., Ши И.М., Карчин Р., Леннон А.М., Хрубан Р.Х. , Томасетти С., Беттеговда С., Кинзлер К.В., Пападопулос Н., Фогельштейн Б. (2020) Оценка анеуплоидии с помощью секвенирования повторяющихся элементов Proc Natl Acad Sci USA, 19 февраля. pii: 201910041. doi: 10.1073/pnas. 1910041117. [Epub перед печатью]

Анагносту В., Никнафс Н., Марроне К., Брум Д.С., Уайт Дж.Р., Найду Дж., Хаммелинк К., Монкхорст К., Лалезари Ф., Ланис М., Рознер С., Ройсс Дж.Е., Смит К.Н., Адлефф В., Роджерс К., Белкейд З., Райми Л. , Леви Б., Фелисиано Дж., Ханн К.Л., Эттингер Д.С., Георгиадес К., Верде Ф., Иллей П., Ли К.К., Барас А.С., Габриэльсон Э., Брок М.Б., Карчин Р., Пардолл Д.М., Байлин С.Б., Брамер Дж.Р., Шарпф Р.Б., Форде PM, Велкулеску VE. (2020) Мультимодальные геномные особенности предсказывают исход блокады иммунных контрольных точек при немелкоклеточном раке легкого Nature Cancer 1 (1), 99-111

2019

Шао С. М., Бхаттачарья Р., Хуан Дж., Сивакумар ИКА, Токхейм С., Чжэн Л., Каминов Б., Омдал А., Бонсак М., Ример А.Б., Велькулеску В.Е., Анагносту В, Пагель К.А., Карчин Р. Высокопроизводительное предсказание неоантигенов МНС класса I и класса II с MHCnuggets Cancer Imm. Рез. дои: 10.1158/2326-6066.CIR-19-0464

Никнафс Н. , Чжун И., Moral JAG, Чжан Л., Шао Х., Ло А., Макохон-Мур А., Якобуцио-Донахью С., Карчин Р. Характеристика генетического Субклональная эволюция в моделях рака поджелудочной железы на мышах. Нат Комм. 2019ноябрь;10(1):5435

Аникеева П., Бойден Э., Брангвинн С., Сиссе И.И., Фин О., Фромм П., Gingras AC, Greene CS, Heard E, Hell SW, Hillman E, Jensen GJ, Карчин Р., Кисслинг Л.Л., Кляйнстивер Б.П., Найт Р., Кукура П., Ланкастер М.А., Ломан Н., Лугер Л., Лундберг Э., Луо К., Мияваки А., Myers EW Jr, Nolan GP, ​​Picotti P, Reik W, Sauer M, Shalek AK, Шендуре Дж., Славов Н., Танай А., Троянская О., ван Вален Д., Ван HW, Yi C, Yin P, Zernicka-Goetz M, Zhuang X. Голоса в разработке методов. Нат Методы 2019октябрь; 16(10):945-951

Спрингер С., Масика Д.Л., Дал Молин М., Доувилль С., Тоберн С.Дж., Афсари Б., Ли Л., Коэн Дж. Д., Томпсон Э., Аллен П. Дж., Климстра Д. С., Шаттнер М. А., Шмидт К.М., Ип-Шнайдер М. , Симпсон Р.Е., Фернандес-Дель Кастильо К., Мино-Кенудсон М., Брюгге В., Брэнд Р.Е., Сингхи А.Д., Скарпа А., Лоулор Р., Salvia R, Zamboni G, Hong SM, Hwang DW, Jang JY, Kwon W, Swan N, Геогеган Дж., Фалькони М., Криппа С., Доглиони С., Паулино Дж., Шулик Р.Д., Эдиль Б.Х., Парк В., Ячида С., Хиджиока С., Ван Хофт Дж., Хе Дж., Вайс М.Дж., Беркхарт Р., Макари М., Канто М.И., Гоггинс М.Г., Птак Дж., Доббин Л., Шефер Дж., Силлман Н., Пополи М., Кляйн А.П., Томасетти К., Карчин Р., Пападопулос Н., Кинзлер К.В., Фогельштейн Б., Вольфганг К.Л., Хрубан Р.Х., Леннон А.И. Мультимодальный тест для лечения пациентов с кистой поджелудочной железы. Sci Transl Med. 201917 июля; 11 (501). номер: eaav4772. дои:

Касак Л., Баколица С., Ху З., Ю.С., Райн Дж., Димстер-Денк Д.Ф., Пандей Г., Де Баэтс Г., Бромберг Ю., Цао К., Каприотти Э., Касадио Р., Ван Дурме Дж., Джолло М., Карчин Р., Катсонис П., Леонарди Э., Лихтарге О., Мартелли П.Л., Масика Д., Муни С.Д., Олатубосун А., Пал Л.Р., Радивояк П. , Руссо Ф., Савохардо С., Шимковиц Дж., Тусберг Дж., Тосатто С.Э., Вихинен М., Валиахо Дж., Репо С., Моулт Дж., Бреннер С.Е., Фридберг I. Оценка вычислительных прогнозов Фенотипический эффект вариантов цистатионин-бета-синтазы Hum Mutat. 201913 июля. doi: 10.1002/humu.23868. [Epub впереди Распечатать]

Tokheim C, Karchin R. CHASMplus раскрывает масштаб соматической миссенс Мутации, вызывающие рак человека. Сотовая система 31 мая. С2405-4712(19)30154-1. doi: 10.1016/j.cels.2019.05.005. [Epub впереди Распечатать]

Фишер К.Г., Гатри В.Б., Брэкстон А.М., Чжэн Л., Ван П., Сонг К., Гриффин Дж.Ф., Чианчиано П.Е., Хосода В., Никнафс Н., Спрингер С., Молин М.Д., Масика Д., Шарпф Р.Б., Томпсон Э.Д., Хе Дж., Вольфганг С.Л., Хрубан Р.Х., Робертс Н.Дж., Леннон А.М., Цзяо Ю., Карчин Р., Вуд ЛД. Внутрипротоковые папиллярные муцинозные новообразования возникают из множественных Независимые клоны, каждый с различными мутациями. Гастроэнтерология. 5 июня. S0016-5085(19)40987-6. doi: 10.1053/j.gastro.2019.06.001.

2018

Анагносту В., Форде П.М., Уайт М.Р., Никнафс Н., Хрубан С., Найду Дж., Марроне К.А., Сивакумар И.К.А., Брум Д.С., Рознер С., Фаллен Дж., Леал А., Адлефф В., Смит К.Н., Коттрелл Т.Р., Райми Л., Палсгроув Д.Н., Ханн К.Л., Леви Б, Фелисиано Дж., Георгиадес К., Верде Ф., Иллей П., Ли К.К., Габриэльсон Э., Брок М.В., Исбелл Дж.М., Заутер Дж.Л., Таубе Дж., Шарпф Р.Б., Карчин Р., Pardoll DM, Chaft JE, Hellmann MD, Brahmer JR, Velculescu VE. Динамика опухолевых и иммунных ответов в течение Блокада иммунных контрольных точек при немелкоклеточном раке легкого. Исследования рака. 12 декабря. pii: canres.1127.2018. дои: 10.1158/0008-5472.CAN-18-1127. [Epub перед печатью]

Кубоки Ю., Фишер К.Г., Белева Гатри В., Хуан В., Ю Дж., Чианчиано П., Хосода В., Чжан Х., Чжэн Л., Шао Х., Томпсон Э.Д., Уотерс К., Полинг Дж., Хе Дж., Вайс М.Дж., Вольфганг С. Л., Гоггинс М.Г., Хрубан Р.Х., Робертс Н.Дж., Карчин Р., Вуд Л.Д. (2018). Секвенирование отдельных клеток определяет генетическую гетерогенность предраковых поражений поджелудочной железы. Журнал патологии. 14 ноября doi: 10.1002/path.5194 [Epub перед печатью]

Райтер Дж.Г., Макохон-Мур А.П., Герольд Дж.М., Хейде А., Аттие М.А., Кохутек З.А., Тохейм С.Дж., Браун А., ДеБлазио Р.М., Ниязов Дж., Цукер А., Карчин Р., Кинзлер К.В., Якобуцио-Донахью К.А., Фогельштейн Б., Новак М.А. (2018). Минимальная гетерогенность функционального драйверного гена среди необработанных метастазов. Наука. 7 сентября; 361 (6406): 1033-1037.

Вуд Д.Е., Уайт М.Р., Георгиадис А., Ван Эмбург Б., Парпарт-Ли С., Митчелл Дж., Анагносту В., Никнафс Н., Карчин Р., Папп Э., МакКорд С., ЛоВерсо П., Райли Д., Диас Л.А. мл., Джонс С., Саузен М., Велкулеску В.Е., Анджуоли СВ. (2018). Подход машинного обучения для обнаружения соматических мутаций. Sci Transl Med. 5 сентября; 10 (457). номер: eaar7939. doi: 10.1126/scitranslmed.aar7939.

Саджулга Р., Мехта С., Кумар П., Джонсон Дж. Э., Герреро Ч. Р., Райан М. С., Карчин Р., Джагтап П.Д., Гриффин Т.Дж. (2018). Объединение проектов по протеому человека, ориентированных на хромосомы, и проектов, связанных с биологией/болезнью: доступные и автоматизированные инструменты для интерпретации биологического и патологического воздействия вариантов белковой последовательности, обнаруженных с помощью протеогеномики. Дж. Протеом Рез. 5 сентября. doi: 10.1021/acs.jproteome.8b00404. [Epub перед печатью]

Бейли М.Х., Токхейм С., Порта-Пардо Э., Сенгупта С., Бертран Д., Вирасинг А., Колаприко А., Вендл М.С., Ким Дж., Рирдон Б., Нг К.С., Чон К.Дж., Цао С., Ван З., Гао Дж., Гао Ц., Ван Ф., Лю Э.М., Муларони Л., Рубио-Перес С., Нагараджан Н., Кортес-Сириано И., Чжоу Д.С., Лян В., Хесс Дж. М., Йеллапантула В. Д., Тамбореро Д., Гонсалес-Перес А., Suphavilai C, Ko JY, Khurana E, Park PJ, Van Allen E, Liang H, Рабочая группа MC3, Исследовательская сеть атласа генома рака, Лоуренс М. , Годзик А., Лопес-Бигас Н., Стюарт Дж., Уилер Д., Гетц Г., Чен К., Лазар А.Дж., Миллс Г.Б., Карчин Р., Дин Л. (2018). Всестороннее открытие и характеристика генов-драйверов и мутаций при раке. Клетка. 173(2):371-385.e18.

Ван И, Ли Л, Доувилль С, Коэн Д.Д., Йен Т.Т., Кинде И., Сандфелт К., Кьер С.К., Хрубан Р.Х., Ши И.М., Ван Т.Л., Курман Р.Дж., Спрингер С., Птак Дж., Пополи М., Шефер Дж., Силлиман Н., Доббин Л., Таннер Э.Дж., Ангарита А., Лике М., Йохумсен К., Афсари Б., Данилова Л., Левин Д.А., Джардон К., Цзэн Х, Арсено Дж., Фу Л., Диас Л.А. младший, Карчин Р., Томасетти С., Кинзлер К.В., Фогельштейн Б., Фейдер А.Н., Гилберт Л., Пападопулос Н. (2018). Оценка жидкости из теста Папаниколау и других жидких биоптатов для выявления рака эндометрия и яичников. Sci Transl Med. 21 марта; 10 (433)

Спрингер С.У., Чен Ч., Родригес Пена MDC, Ли Л., Доувилль С., Ван И., Коэн Д.Д., Тахери Д. , Силлиман Н., Шефер Дж., Птак Дж., Доббин Л., Паполи М., Кинде И., Афсари Б., Трегнаго А.С., Безерра SM, VandenBussche C, Fujita K, Ertoy D, Cunha IW, Yu L, Bivalacqua TJ, Grollman AP, Diaz LA, Karchin R, Danilova L, Huang CY, Shun CT, Turesky RJ, Yun BH, Rosenquist TA, Pu YS, Хрубан Р.Х., Томасетти С., Пападопулос Н., Кинзлер К.В., Фогельштейн Б., Дикман К.Г., Нетто Г.Дж. (2018). Неинвазивное выявление уротелиального рака посредством анализа мутаций драйверного гена и анеуплоидии. Элиф. 20 марта;7. номер: e32143.

Ng PK, Li J, Jeong KJ, Shao S, Chen H, Tsang YH, Sengupta S, Wang Z, Бхавана В.Х., Тран Р., Соевито С., Минусси Д.С., Морено Д., Конг К., Догрулук T, Lu H, Gao J, Tokheim C, Zhou DC, Johnson AM, Zeng J, Ip CKM, Ju Z, Вестер М., Ю С., Ли И, Веллано С.П., Шульц Н., Карчин Р., Дин Л., Лу Ю., Чунг ЛВТ, Чен К., Шоу К.Р., Мерик-Бернстам Ф., Скотт К.Л., Йи С., Сахни Н, Лян Х, Миллс Г.Б. (2018). Систематическая функциональная аннотация соматических мутаций при раке. Раковая клетка. 33(3):450-462.e10

Гатри В.Б., Масика Д.Л., Фрейзер А., Федерико Дж., Фан Ю., Кэмпс М., Карчин Р. (2018). Сетевой анализ адаптации белков: моделирование функционального воздействия нескольких мутации. Мол. биол. Эво. msy036, https://doi.org/10.1093/molbev/msy036 [Epub перед печатью]

Фельзенштейн М., Ноэ М., Масика Д.Л., Хосода В., Кьянчиано П., Фишер CG, Lionheart G, Brosens LAA, Pea A, Yu J, Gemenetzis G, Groot VP, Макари М.А., Хе Дж., Вайс М.Дж., Кэмерон Дж.Л., Вольфганг С.Л., Хрубан Р.Х., Робертс Н.Дж., Карчин Р., Гоггинс М.Г., Вуд Л.Д. (2018) IPMN с сопутствующим инвазивным раком: соседи, но не всегда родные. Гут, 2 марта. pii: gutjnl-2017-315062. doi: 10.1136/gutjnl-2017-315062. [Epub перед печатью]

Доувиль С., Спрингер С., Кинде И., Коэн Дж. Д., Хрубан Р. Х., Леннон А. М., Пападополус Н., Кинзлер К.В., Фогельштейн Б., Карчин Р. (2018) Выявление анеуплоидии у больных с рак за счет амплификации длинных вкраплений нуклеотидов элементы (линии) Proc Natl Acad Sci USA 115(8):1871-1876

Гуйдугли Л. , Шимелис Х., Масика Д.Л., Панкрац В.С., Липтон Г.Б., Сингх Н., Ху C, Монтейро А.Н., Линдор Н.М., Голдгар Д.Э., Карчин Р., Иверсен Э.С., Коуч ФДж (2018) Оценка клинической значимости BRCA2 варианты миссенс с помощью функционального и вычислительного подходов. Являюсь. Журнал генетики человека. S0002-9297(17)30502-5

2017

Оттинг В.С., Бероуд С., Бреннер С.Е., Гринблатт М.С., Карчин Р., Муни С.Д. (2017) Методы и инструменты для оценки влияния генетических вариаций: ежегодное научное собрание Общества вариаций генома человека 2017 г. Мутация человека. 39(3):460-463.

Masica DL, Douville C, Tokheim C, Bhattacharya R, Kim R, Moad K, Ryan MC, Карчин Р. (2017) CRAVAT 4: Набор инструментов для анализа вариантов, связанных с раком. Исследования рака. 1 ноября; 77(21):e35-38.

Лабиди-Гали С.И., Папп Э., Халлберг Д., Никнафс Н., Адлефф В., Ноэ М., Бхаттачарья Р., Новак М., Джонс С., Фаллен Дж., Хрубан К.А., Хирш М.С., Лин DI, Schwartz L, Maire CL, Tille JC, Bowden M, Ayhan A, Wood LD, Шарпф Р. Б., Курман Р., Ван Т.Л., Ши И.М., Карчин Р., Драпкин Р., Велкулеску В.Е. (2017) Высокая степень серозного рак яичников возникает в маточной трубе. Нац. коммун. 23 октября; 8 (1): 1093.

Глусман Г., Роуз П.В., Прлич А., Догерти Дж., Дуарте Дж.М., Хоффман А.С., Бартон Г.Дж., Бендиксен Э., Бергквист Т., Бок С., Брунк Э., Бульян М., Берли С.К., Кай Б., Картер Х., Гао Дж., Годзик А. , Хойер М., Хикс М., Грабе Т., Карчин Р., Леман Дж. К., Лейн Л., Масика Д. Л., Муни С. Д., Моулт Дж., Оменн Г. С., Перл Ф., Педжавер В., Рейнольдс С. М., Рокем А., Шведе Т., Сонг С., Тилгнер Х, Валасатава Ю, Чжан Ю, Дойч Э.В. (2017) Картирование генетических вариаций трехмерных белковых структур для улучшения интерпретации вариантов: предлагаемая структура. Геном Мед. 8;9(1):113

Monson ET, Pirooznia M, Parla J, Kramer M, Goes FS, Gaine ME, Gaynor СК, де Клерк К., Янчич Д., Карчин Р., Маккомби В.Р., Занди П.П., Поташ Д.Б., Уиллур В.Л. (2017) Оценка данных последовательности всего экзома при попытке самоубийства в когорте пациентов с биполярным расстройством. Мол нейропсихиатрия. Июль; 3(1):1-11.

Кай Б., Ли Б., Кига Н., Тусберг Дж., Бергквист Т., Чен Ю.С., Никнафс Н., Картер Х., Тохейм С., Белева-Гатри В., Дувиль С., Бхаттачарья Р., Грейс Йео Х.Т., Фан Дж., Сенгупта С., Ким Д., Клайн М., Тернер Т., Дикханс М., Zaucha J, Pal LR, Cao C, Yu CH, Yin Y, Carraro M, Giollo M, Ferrari C, Леонарди Э., Тосатто SCE, Бобе Дж., Болл М., Хоскинс Р., Репо С., Черч Г., Бреннер С.Е., Моулт Дж., Гоф Дж., Станке М., Карчин Р., Муни С.Д. (2017) Сопоставление фенотипов с целыми геномами: уроки, извлеченные из четырех итераций задач сообщества проекта персонального генома. Хум Мутат. 23 мая. doi: 10.1002/humu.23265. [Epub перед печатью]

Фу Дж., Сен Р., Масика Д.Л., Карчин Р., Пардолл Д., Уолтер В., Хейс Д.Н., Чанг Ч, Ким Ю.Дж. (2017) Аутологичная реконструкция рака человека и иммунной системы in vivo. Онкотаргет. 10 января; 8 (2): 2053–2068.

Оттинг В.С., Бероуд С., Бреннер С.Е., Гринблатт М., Карчин Р., Муни С.Д., Сюняев С. (2017) Некодирующая вариация: The Ежегодная научная встреча 2016 г., посвященная вариациям генома человека Общество. Хум Мутат. 38(4):460-463.

Masica DL, Dal Molin M, Wolfgang CL, Tomita T, Ostovaneh MR, Blackford A, Moran RA, Law JK, Barkley T, Goggins M, Irene Canto M, Pittman M, Eshleman JR, Ali SZ, Fishman EK, Kamel IR, Raman SP, Zaheer A, Ahuja N, Makary MA, Weiss MJ, Hirose K, Cameron JL, Rezaee N, He J, Joon Ahn Y, Wu W, Wang Y, Springer S, Diaz LL Jr, Papadopoulos N, Hruban Р.Х., Кинзлер К.В., Фогельштейн Б., Карчин Р., Мари Леннон А. (2017) Новый подход к выбору комбинированных клинических маркеров патологии применен к большой ретроспективной когорте хирургически резецированных кист поджелудочной железы. J Am Med Inform Assoc Jan; 24 (1): 145-152.

2016

Анагносту В., Смит К.Н., Форде П.М., Никнафс Н., Бхаттачарья Р., Уайт Дж., Чжан Т., Адлефф В., Фаллен Дж., Вали Н., Хрубан С., Гатри В.Б., Роджерс К., Найду Дж., Канг Х., Шарфман В. Х., Георгиадес С. , Verde F, Illei P, Li QK, Gabrielson E, Brock MV, Zahnow CA, Baylin SB, Scharpf R, Brahmer JR, Karchin R, Pardoll DM, Velculescu VE. (2016) Эволюция ландшафта неоантигенов во время Блокада иммунных контрольных точек в немелкоклеточном легком Рак. Рак Дисков. 7(3):264-276

Тохейм С., Папдопулис Н., Кинзлер К.В., Фогельштейн Б., Карчин Р. (2016) Оценка оценки фактора рака гены. Proc Natl Acad Sci USA. Dec 13;113(50):14330-14335.

Карчин Р., Нусинов Р. (2016) Геномные ландшафты болезней: стратегии предсказать фенотипические последствия человеческого зародышевого и соматического вариация. PLoS Comput Biol. 18 августа; 12(8):e1005043

Массия Д.Л., Карчин Р. (2016) На пути к повышению клинической значимости методов in silico для предсказать патогенные миссенс-варианты. PLoS Вычисления Биология. 12 мая;12(5):e1004725.

Тохейм С., Бхаттачарья Р., Никнафс Н., Гигакс Д.М., Ким Р., Райан М., Масика Д.Л., Карчин Р. (2016) Открытие очаговой мутации в масштабе экзома области рака человека с использованием 3D-белка структура исследования рака. 1;76(13):3719-31

Гоес Ф.С., Пироозня М., Парла Дж.С., Крамер М., Гибан Э., Маврук С., Чен Ю.К., Монсон Э.Т., Уиллур В.Л., Карчин Р., Фликингер М., Локк А.Е., Леви С.Е., Скотт Л.Дж., Бонке М., Шталь Э., Моран Д.Л. , Hultman CM, Landén M, Purcell SM, Sklar P, Zandi PP, McCombie WR, Potash JB. (2016) Секвенирование экзома биполярного расстройства Джама Психиатрия. июнь 1:73(6):590-7

Оттинг В.С., Бреннер С.Е., Брукс А.Дж., Гринблатт М.С., Харт Р.К., Карчин Р, Сюняев С.Р., Ташнер П.Е. (2016) Интерпретация патогенности в Эпоха точной медицины: ежегодное научное совещание 2015 г. Общество вариаций генома человека. Мутация человека. 21 января. Дои: 10.1002/гуму.22958. [Epub перед печатью]

Реттиг Э.М., Талбот-младший К.С., Саузен М., Джонс С., Бишоп Дж.А., Вуд Л.Д., Тохейм С., Никнафс Н., Карчин Р., Пападопулос Н., Кинзлер К. В., Фогельштейн Б., Ха П.К., Агравал Н. (2016) Полногеномное секвенирование слюнной железы аденоидно-кистозная карцинома. Исследования по профилактике рака. 9 фев. pii:canprevres.0316.2015. [Epub перед печатью].

Робертс Н.Дж., Норрис А., Петерсен Г.М., Бонди М.Л., Брэнд Р., Галлинджер С., Kurtz RC, Olson SH, Rustgi AK, Schwartz AG, Stofel E, Syngal S, Зогопулос Г., Али С.З., Аксилбунд Дж., Чаффе К.Г., Чен Ю.К., Кот М.Л., Чайлдс EJ, Douville C, Goes FS, Herman JM, Iacobuzio-Donahue C, Kramer M, Макохон-Мур А., Маккомби В.Р., МакМахон К., Никнафс Н., Парла Дж., Пироозния М., Поташ Д.Б., Рим А.Д., Смит А.Л., Ван И, Вулофганг С.Л., Вуд Л.Д., Занди П.П., Гоггинс М., Карчин Р., Эшлеман Дж., Пападопулос Н., Кинзлер К.В., Фогельштейн Б., Хрубан Р.Х., Кляйн А.П. (2016) Полногеномное секвенирование пациентов с семейным раком поджелудочной железы Cancer Discovery. 9 декабря. пии: CD-15-0402. [Epub перед печатью].

Дувиль С., Масика Д.Л., Стенсон П.Д., Купер Д.Н., Гайгакс Д. , Ким Р., Райан М., Карчин Р. (2016) Оценка патогенности введения и удаление вариантов с помощью инструмента оценки эффекта варианта (VEST-indel) Мутация человека. 37(1):28-35

2015

Никнафс Н., Гатри В.Б., Найман Д.К., Карчин Р. (2015) Вывод субклональной иерархии из Соматические мутации: автоматическая реконструкция эволюции рака деревья из мультирегионального секвенирования следующего поколения. PLoS Вычислительная биология. 11(10):e1004416

Бертотти А., Папп Э., Джонс С., Адлефф В., Анагносту В., Саузен М., Фаллен Дж., Тохейм С., Никнафс Н., Нессельбуш М., Литл К., Коттино Ф., Мильярди Г., Дзанелла Э.Р., Риберо Д., Руссолилло Н., Меллано А., Мураторе А, Паралуппи Г., Салиццони М., Марсони С., Краг М., Лантто Дж., Кассингена А., Ли К.К., Карчин Р., Шарпф Р., Сарторе-Бьянки А., Сиена С., Диас Л.А., Трусолино Л., Велкулеску В.Е. (2015) Геномный ландшафт реакции на EGFR Блокада при колоректальном раке. Природа. 526 (7572): 263-7

Спрингер С. , Ван И., Дал Молин М., Масика Д.Л., Цзяо И., Кинде И., Блэкфорд А., Раман С.П., Вольфганг С.Л., Томита Т., Никнафс Н., Доувилль С., Птак Дж., Доббин Л., Аллен П.Дж., Климстра Д., Шаттнер М.А., Шмидт К.М., Ип-Шнайдер М., Каммингс OW, Brand RE, Zeh JH, Singhi AD, Scarpa A, Salvia R, Malleo G, Zamboni G, Falconi M, Jang JY, Kim SW, Kwon W, Hong SM, Song KB, Ким С.К., Свон Н., Мерфи Дж., Геогеган Дж., Брюгге В., Фернандес-Дель Кастильо К., Мино-Кенудсон М., Шулик Р., Эдил Б.Х., Адсей В., Паулино Дж., Ван Хуф Дж., Ячида С., Нара С., Хираока Н., Ямао К., Хиджока С., ван дер Мерве С., Гоггинс М., Канто М.И., Ахуга Н., Хиросе К., Макари М., Вайс М.Дж., Кэмерон Дж., Питтман М., Эшлеман Дж.Р., Диаз-младший Л.А., Пападопулос Н., Кинзлер К.В., Карчин Р., Хрубан Р., Фогельштейн Б., Леннон А.М. (2015) Комбинация молекулярных маркеров и Клинические признаки улучшают классификацию поджелудочной железы кисты. Гастероэнтерология. 149(6): 1501-10

Тернер Т.Н., Доувилль С. , Ким Д., Стенсон П.Д., Купер Д.Н., Чакраварти А, Карчин Р. (2015) Белки, связанные с аутосомно-доминантные и аутосомно-рецессивные заболевания характерное распределение редких миссенс-мутаций узоры Hum Mol Genet. 24(21):5995-6002

Чанг Ч., Гатри В. Б., Масика Д., Токхейм С., Канг Х., Ричмон Дж., Аграва Н., Гоурин С., Куон Х., Зуо З., Сейверт Т., Али С.М., Миллер В.А., Фрэмптон Г.М., Чалмерс З.Р., Карчин Р., Бишоп Дж. (2015)Генетические изменения плоскоклеточного рака головы и шеи клеточная карцинома, определяемая раковым геном-мишенью последовательность действий. Энн Онкол. 26(6):1216-23

Карчин Р., Клайн М.С. (2015) Специальный выпуск по генетике человека вычислительная молекулярная медицина Генетика человека. 134(5):455-7

Оттинг В.С., Гринблатт М.С., Брукс А.Дж., Карчин Р., Муни С.Д. (2015) Зародышевая линия и соматический мозаицизм: Ежегодная научная встреча 2014 г., посвященная вариациям генома человека. Общество. Человеческий мутат. 36(3):390-3

Реттиг Э.М., Чанг Ч., Бишоп Дж. А., Ховард Дж. Д., Шарма Р., Ли Р. Дж., Дувилль К., Карчин Р., Изумченко Э., Сидрански Д., Кох В.М., Калифано Дж., Агравал N, Fakhry C (2015) Расщепленная экспрессия NOTCh2 картина плоскоклеточного рака головы и шеи связана с мутацией NOTCh2, статусом ВПЧ и клиническим риском высокого риска Особенности. Рак Пред. Рез. 8(4):287-95

Masica DL, Li S, Douville C, Manola J, Ferris RL, Burtness B, Forastiere AA, Koch WM, Chung CH, Karchin R (2015) Прогнозирование выживания в области головы и шеи плоскоклеточный рак из-за мутации TP53. Человек Генетика. 134(5):497-507

2014

Masica DL, Sosnay PR, Raraigh KS, Cutting GR, Karchin R (2014) Миссенс-варианты в нуклеотидсвязывающих доменах CFTR предсказывают количественные фенотипы, связанные с тяжестью муковисцидоза. Человеческий мол. Генетика. 24(7):1908-17

Чен Ю.С., Доувилль С., Ван С., Никнафс Н., Йео Г. , Белева-Гатри В., Картер Х., Стенсон П.Д., Купер Д.Н., Ли Б., Муни С., Карчин Р. (2014) Вероятностная модель для прогнозирования клинических фенотипические признаки из секвенирования генома. PLoS Вычисления Биология. 4 сент. 10(9):e1003825

Шарма Н., Соснай П.Р., Рамальо А.С., Доувиль С., Франка А., Готтшалк Л.Б., Парк Дж., Ли М., Веккио-Паган Б., Сиклоси К., Амарал М.Д., Карчин Р., Каттинг Г. (2014) Экспериментальная оценка вариантов сплайсинга использование минигенов экспрессии и сравнение с in silico предсказания Мутация человека. 35(10):1249-59

Ли Л., Масика Д.Л., Ишида М., Томулеаса С., Умегак С., Каллу А.Н., Георгиадес С., Сингх В.К., Хашаб М., Амато С., Ли З., Около П., Леннон А.М., Саксена П., Гешвинд Дж. Ф., Шлахтер Т., Хонг К. , Павлик ТМ, Канто М., Лоу Дж., Шараиха Р., Вайс К.Р., Пэн Х., Тулуват П., Гоггинс М., Шин Э.Дж., Кумбхари В., Хатфлесс С., Чжоу Л., Мезей Э., Мельцер С.Дж., Карчин Р., Селару Ф.М. (2014) Желчь человека содержит экзосомы, нагруженные микроРНК, которые можно использовать для диагностики холангиокарциномы. Гепатология. 60(3):896-907

Картер Х., Карчин Р. (2014) Прогнозирование функциональных последствий соматических миссенс-мутаций, обнаруженных в опухолях. Методы молекулярной биологии, анализ функций генов, 2-е изд., под ред. Окс МФ. Хумана Пресс.

2013

Цзяо Ю., Павлик Т.М., Андерс Р.А., Селару Ф.М., Стреппель М.М., Лукас Д.Дж., Никнафс Н., Гатри В.Б., Майтра А., Аргани П., Офферхаус Г.Дж., Роа Д.К., Робертс Л.Р., Горес Г.Дж., Попеску И., Александреску С.Т., Дима С. , Фассан М., Симболо М., Маффицини А., Капелли П., Лоулор Р.Т., Рузененте А., Гульельми А., Тортора Г., де Бро Ф., Скарпа А., Ярнагин В., Климстра Д., Карчин Р., Велькулеску В.Е., Хрубан Р.Х., Фогельштейн Б., Кинзлер К.В., Пападопулос Н., Вуд Л.Д. (2013) Секвенирование экзома идентифицирует частые инактивирующие мутации в BAP1, ARID1A и PBRM1 при внутрипеченочных холангиокарциномах. Нац. Генетика. Декабрь; 45 (12): 1470-3

Соснай П.Р., Сиклоши К.Р., Ван Гур Ф. , Канецки К., Ю Х., Шарма Н., Рамальо А.С., Амарал М.Д., Дорфман Р., Зеленски Дж., Масика Д.Л., Карчин Р., Миллен Л., Томас П.Дж., Патринос Г.П., Кори М., Льюис MH, Rommens JM, Castellani C, Penland CM, Cutting GR (2013) Определение склонности к заболеванию мутаций в гене регулятора трансмембранной проводимости муковисцидоза. Нац. Генетика. 45(10):1160-7

Хоанг М.Л., Чен Ч., Сидоренко В.С., Хе Дж., Дикман К.Г., Юн Б.Х., Мория М., Никнафс Н., Доувиль С., Карчин Р., Турески Р.Дж., Пу Ю.С., Фогельштейн Б., Пападопулос Н., Гроллман А.П., Кинзлер К.В., Розенквист Т. (2013) A. Мутационная сигнатура воздействия аристолоховой кислоты, выявленная при секвенировании всего экзома. Научная трансляционная медицина. 5(197):197ra102

Gartner JJ, Parker SCJ, Prickett TD, Dutton-Reester K, Lin JC, Simhadri VL, Jha S, Katagiri N, Gotea V, Teer JK, Wei X, Bhanot UK, Программа сравнительного секвенирования NISC, Willard MD, Chen G, Elnitski Л., Дэвис М.А., Гершенвальд Дж. Э., Картер Х., Карчин Р., Барбер Т.Д., Робинсон В., Робинсон С., Розенберг С.А., Комар А.А., Кимчи-Сарфати С., Хейворд Н.К., Маргилес Э.Х., Сэмюэлс И. (2013) Полногеномное секвенирование идентифицирует повторяющуюся функциональную синонимическую мутацию при меланоме. Proc Natl Acad Sci USA. 110(33):13481-6

Подгруппа по путям и последствиям мутаций Международного консорциума генома рака рабочей группы по анализу биоинформатики, Гонсалес-Перес А., Мустонен В., Рева Б., Ричи Г. Р., Крейксел П., Карчин Р., Васкес М., Финк Дж. Л., Кассан К. С., Пирсон Дж. В., Бадер Г. Д. , Бутрос П.С., Мутусвами Л., Уэллетт Б.Ф., Рейманд Дж., Линдинг Р., Шибата Т., Валенсия А., Батлер А., Дронов С., Фличек П., Шеннон Н.Б., Картер Х., Дин Л., Сандер С., Стюарт Дж.М., Стейн Л.Д., Лопес -Бигас Н. (2013) Вычислительные подходы к идентификации функциональных генетических вариантов в геномах рака. Нат Методы.10(8):723-9

Картер Х., Доувилль С., Йео Г., Стенсон П.Д., Купер Д.Н., Карчин Р. (2013) Идентификация генов менделевской болезни с помощью инструмента оценки вариантов эффекта. Геномика BMC. 14(3) 1-16.

Никнафс Н., Ким Д., Ким Р., Диханс М., Райан М., Карчин Р. (2013) MuPIT Interactive: веб-сервер для сопоставления позиций вариантов с аннотированными интерактивными трехмерными структурами. Генетика человека. 132(11):1235-43

Доувилль С., Картер Х., Ким Р., Никнафс Н., Диханс М., Стенсон П.Д., Купер Д.Н., Райан М., Карчин Р. (2013) CRAVAT: набор инструментов для анализа связанных с раком вариантов. Биоинформатика. 29(5): 647-8

Масика Д.Л. и Карчин Р. (2013) Коллекции одновременно измененных генов как биомаркеры реакции раковых клеток на лекарства. Исследования рака. 73(6):1699-708

Чен Ю.К., Картер Х., Парла Дж., Крамер М., Гоуз Ф.С., Пироозня М., Занди П.П., МакКомби В.Р., Поташ Д.Б., Карчин Р. (2013) Гибридная модель правдоподобия для исследований ассоциации заболеваний на основе последовательностей. Генетика PLoS. 9(1): e1003224

2012

Вудс Н., Мескита Р.Д., Сладкий М., Карвалью М.А., Ли Х, Лю Ю., Нгуен Х., Марсиллак С., Карчин Р., Кумен Дж., Монтейру А.Н. (2012) Диаграмма ландшафта тандемных взаимодействий белков, опосредованных доменом BRCT. Сигнализация науки. 5(242):rs6

Лян Х, Чунг ЛВТ, Ли Дж, Ю З, Ю С, Стемке-Хейл К, Догрулук Т, Лу Ю, Лю Х, Гу С, Шерер СЭ, Картер Х, Вестин С.Н., Верхаак Р, Чжан Ф, Карчин Р, Лю К.Г., Лу К.Х., Броддус Р.Р., Скотт К.Л., Хеннесси Б.Т., Миллс ГБ (2012) Полноэкзомное секвенирование в сочетании с функциональной геномикой выявило новые гены-кандидаты в качестве драйвера рака эндометрия. Геномные исследования. 22 ноября (11): 2120-9

Масика Д.Л., Соснай П., Резка Г., Карчин Р. (2012) Ансамбли последовательностей, оптимизированные по фенотипу, существенно улучшают прогнозирование мутаций, вызывающих заболевание, при муковисцидозе. Мутация человека. 33(8):1267-74

Цзяо X, Вуд Л. , Линдман М., Джонс С., Бакхаултс П., Поляк К., Сукумар С., Картер Х., Ким Д., Карчин Р. и Сджоболом Т. (2012) Соматические мутации в путях Notch, NF-KB, PIK3CA и hedgehog при раке молочной железы человека. Гены, хромосомы и рак. 51(5):480-9

Ву Дж., Цзяо И., Дал Молин М., Майтра А., де Вильде Р.Ф., Вуд Л.Д., Эшлеман Дж.Р., Гоггинс М.Г., Вольфганг С.Л., Канто М.Л., Шулик Р.Д., Эдил Б.Х., Чоти, М.А., Адсей В., Кимстра Д.С., Офферхаус Г.Я., Кляйн А.П., Копелович Л., Картер Х., Карчин Р., Аллен П.Дж., Шмидт К.М., Матио Ю., Диас Л., Кинцлер К.В., Пападополус Н., Грубан Р.Х., Фогельштейн Б. (2011) Полноэкзомное секвенирование неопластических кист поджелудочной железы выявляет повторяющиеся мутации в компонентах убиквитин-зависимых путей. Proc Natl Acad Sci USA. 108(52):21188-93

Карчин Р., Окс М.Ф., Стюарт Дж.М., Бадер Дж.С. (2012) Идентификация аберрантного пути и сетевой активности по высокопроизводительным данным. Pac Symp Biocomput 2012 17: 1-6

2011

Белева-Гатри В. , Аллен Дж., Кэмпс М. и Карчин Р. (2011) Сетевые модели мутаций β-лактамазы TEM, коэволюционирующих при отборе антибиотиков, демонстрируют модульную структуру и предвосхищают эволюционные траектории. PLoS Вычислительная биология. 7(9):e1002184

Ли Д., Карчин Р., Бир М. (2011) Дискриминационное предсказание энхансеров млекопитающих по последовательности ДНК. Геномные исследования. 21(12):2167-80

Текучева С., Маркионни Л., Карчин Р., Пармиджани Г. (2011) Интеграция разнообразных геномных данных с использованием наборов генов. Геномная биология. 23:R105, 21 октября 2011 г.

Лю Ю, Вудс Н, Ким Д, Монтейро АНА, Карчин Р (2011) Мусорные последовательности с двумя гибридами дрожжей содержат выбранные линейные мотивы. Исследование нуклеиновых кислот. 39(19):e128

Вонг В.К., Ким Д., Картер Х., Диханс М., Райан М. и Карчин Р. (2011) CHASM и SNVBox: набор инструментов для обнаружения биологически важных однонуклеотидных мутаций при раке. Биоинформатика. 27(15):2147-8

Чжан X, Рейс М., Хориати Р., Ли И., Уйлетт П., Самайоа Дж., Картер Х., Карчин Р., Ли М., Диас Л., Велькулеску В.Е., Кинзлер К.В., Фогельштейн Б. и Малек С.Н. (2011) Анализ последовательности 515 генов киназ при хроническом лимфоцитарном лейкозе. Лейкемия. 25(12):1908-10

Goes FS, Rongione M, Chen YC, Karchin R, Elhalk E и Potash JB (2011) Секвенирование экзонной ДНК ERBB4 при биполярном расстройстве. ПЛОС Один. 6(5):e20242

Аллен Дж., Симха Д., Эриксон Н., Александр Д., Тролль С., Маркетт Дж., Ван Бибер Б., Эрнандес Дж., Карчин Р., Биелас Дж., Леб Л., Кэмпс М. (2011) Роль ДНК-полимеразы I в репликации ведущей и отстающей цепи определяется мутационным следом репликации плазмиды ColE1 с высоким разрешением. Нуклеиновые Кислоты Res. 39(16):7020-7033

Исследовательская сеть атласа генома рака (2011 г.) Комплексный геномный анализ рака яичников. Природа. 2011;474:609-615

Масика Д. Л. и Карчин Р. (2011) Корреляция между экспрессией соматических мутаций идентифицирует гены, важные для прогрессирования и выживания глиобластомы человека. Исследования рака. 1 июля; 71 (13): 4550-61

Сосней П.Р., Кастеллани С., Кори М., Дорфман Р., Зеленски Дж., Карчин Р., Пенланд С.М., Каттинг Г.Р. (2011) Оценка склонности к заболеванию вариантов CFTR. Методы Мол Биол. 2011;742:355-72

Парсонс Д.В., Ли М., Чжан Х., Джонс С., Лири Р., Лин Дж., Бока С., Картер Х., Самайоа Дж., Беттеговда С., Галлия Г.Л., Джалло Г.И., Биндер З.А., Никольский Ю., Хартиган Дж., Смит Д.Р., Герхард Д.С. , Fults DW, VandenBerg S, Berger MS, Marie SKN, Shinjo SMO, Clara C, Phillips PC, Minturn JE, Biegel J, Judkins AR, Resnick AC, Storm PB, Curran T, He Y, Tasheed BA, Friedman H, Keir ST, McLendon R, Northcott PA, Taylor MD, Burger PC, Riggins GJ, Karchin R, Parmigiani G, Bigner DD, Yan H, Papdopoulos N, Vogelstein B, Kinzler KW и Velculescu V. (2011) Генетический ландшафт раковой медуллобластомы у детей. Наука. 28 января; 331 (6016): 435-9

Клайн М.С. и Карчин Р. (2011) Использование биоинформатики для прогнозирования функционального воздействия SNV. Биоинформатика. 15 февраля; 27 (4): 441-8. 15 декабря

Окс М.Ф., Карчин Р., Рессом Х. и Джентльмен Р. (2011) Идентификация аберрантного пути и сетевой активности по данным с высокой пропускной способностью — введение в семинар. Pac Symp Biocomput. 2011: 364-8

2010

Божич И., Антал Т., Оцуки Х., Картер Х., Ким Д., Чен С., Карчин Р., Кинзлер К.В., Фогельштейн Б., Новак М.А. (2010) Накопление мутаций водителя и пассажира при прогрессировании опухоли. Proc Natl Acad Sci USA. 26 октября; 107 (43): 18545-50.

Келли Л., Фукусима Х., Карчин Р., Гоу Дж.М., Чинн Л.В., Пипер У., Сегал М.Р., Кроец Д.Л., Сали А. (2010) Функциональные горячие точки в доменах связывания нуклеотидов транспортера ABC человека. Белковая наука. 19 (11) ноября: 2110-21

Картер Х. , Самайоа Дж., Хрубан Р.Х., Карчин Р. (2010) Приоритизация драйверных мутаций при раке поджелудочной железы с использованием канцер-специфической высокопроизводительной аннотации соматических мутаций (CHASM). Биология и терапия рака. 31 сентября; 10 (6): 582-7.

2009

Картер Х., Чен С., Исик Л., Текучева С., Велкулеску В.Е., Кинзлер К.В., Фогельштейн Б., Карчин Р. (2009) Высокопроизводительная аннотация соматических мутаций, специфичная для рака: компьютерное прогнозирование мутаций миссенс-драйвера. Исследование рака. 69(16):6660-7

Шварц Р., Зайбель П.Н., Рахманн С., Шон С., Хюнерберг М., Мюллер-Рейбл С., Дандекар Т., Карчин Р., Шульц Дж., Мюллер Т. (2009) Обнаружение зависимостей между видами и сайтами в больших множественных выравниваниях последовательностей. Нуклеиновые Кислоты Res. 37(18):5959-68

Райан М., Диханс М., Лиен С., Лю Ю., Карчин Р. (2009) LS-SNP/PDB: аннотированные несинонимичные SNP, сопоставленные со структурами банка данных белков. Биоинформатика. 25(11):1431-2

Карчин Р. (2009) Инструменты нового поколения для аннотирования SNP человека. Брифинг по биоинформатике. 10(1):35-52

Пипер У., Эсвар Н., Уэбб Б.М., Эрамиан Д., Келли Л., Баркан Д., Картер Х., Манку П., Карчин Р., Марти-Реном М., Дэвис Ф. и Сали А. (2009) MODBASE, база данных аннотированных сравнительных структурных моделей и связанных ресурсов. Nucleic Acids Res, 37 (выпуск базы данных): D347-54.

Карвалью М., Пино М.А., Карчин Р., Беддор Дж., Годиньо-Нетто М., Мескита Р.Д., Родарте Р.С., Ваз Д.К., Монтейро В.А., Манукян С., Коломбо М., Рипамонти С., Розенквист-Брэнделл Р., Сазерс Г., Борг А., Радис П., Грист С.А., Монтейро А.А. и Биллак Б. (2009) Анализ вариантов BRCA1 с промахом, сдвигом рамки и удалением внутри рамки. Мутационные исследования. 15 января; 660(1-2):1-11.

2008

Джонс С., Чжан Х, Парсонс Д.В., Лин Дж., Лири Р.Дж., Ангенендт П., Манку П., Картер Х., Камияма Х. , Химено А., Хонг С.М., Фу, Б., Лин, МТ, Калхун Э.С., Камияма М., Уолтер К., Никольская Т., Никольский Ю., Хартиган Дж., Смит Д.Р., Идальго М., Лич С.Д., Клейн А.П., Джаффи Э.М., Гоггинс М., Майтра А., Якобузио-Донахью С., Эшлеман Дж.Р., Керн С.Е., Хрубан Р.Х., Карчин Р., Пападопулос Н. , Пармиджани Г., Фогельштейн Б., Велкулеску В.Е., Кинцлер К.В. (2008)Основные сигнальные пути при раке поджелудочной железы человека, выявленные глобальным геномным анализом. Наука, 26:1801-1806

Парсонс Д.В., Джонс С., Чжан Х, Лин Дж., Лири Р.Дж., Ангенендт П., Манку П., Картер Х., Су И.М., Галлия Г., Оливи А., МакЛендон Р., Рашид Б.А., Кейр С., Никольская Т., Никольский Ю., Бусам Д.А. , Tekleab H, Diaz LA, Hartigan J, Smith DR, Strausberg RL, Marie SKN, Shinjo SMO, Yan H, Riggins GJ, Bigner DD, Karchin R, Papadopoulos N, Parmigiani G, Vogelstein B, Velculescu VE, Kinzler KW. (2008) Комплексный геномный анализ мультиформной глиобластомы человека Science. 26:1807-1812

Манку П. , Сукумар С., Карчин Р. (2008) Соматические мутации PIK3CA при раке молочной железы: механистические выводы из моделирования динамики Ланжевена. Белки 10 сентября; 75 (2): 499-508

Кацман С., Барретт С., Тилтген Г., Карчин Р., Карплюс К. (2008) Predict-2nd: инструмент для обобщенного предсказания локальной структуры белка Биоинформатика. 1 ноября; 24(21):2453-9.

Карчин Р., Коуч Ф., Агарвал М., Сали А. и Битти М.С. (2008) Классификация неклассифицированных вариантов BRCA2 с использованием отношения правдоподобия белка. Информатика Рака 4:1-14

2007

Вуд Л.Д., Парсонс Д.В., Джонс С., Лин Дж., Сьоблом Т., Лири Р.Дж., Шен Д., Бока С.М., Барбер Т., Птак Дж., Силлиман Н., Сабо С., Дезо З., Устянский В., Никольская Т., Никольский Ю., Карчин Р. , Уилсон П.А., Каминкер Дж.С., Чжан З., Крошоу Р., Уиллис Дж., Доусон Д., Шипицин М., Уилсон Дж.К., Сукумар С., Поляк К., Парк Б.Х., Петиягода К.Л., Пант П.В., Баллинджер Д.Г., Спаркс А. Б., Хартиган Дж., Смит DR, Suh E, Papadopoulos N, Buckhaults P, Markowitz SD, Parmigiani G, Kinzler KW, Velculescu VE, Vogelstein B. (2007) Геномные ландшафты человеческого рака молочной железы и колоректального рака. Наука 16 ноября; 318(5853):1108-13

Карчин Р., Монтейро А.Н., Карвальо М.А., Тавтигян С.В. и Сали А. (2007) Функциональное влияние миссенс-мутантов в BRCA1, предсказанное контролируемым обучением. PLoS Вычислительная биология 3(2):e26

Келли Л., Карчин Р. и Сали А. (2007)Взаимодействия белков и фенотипы заболеваний в суперсемействе переносчиков ABC. Тихоокеанский симпозиум по биокомпьютерам 12:51-63

Карвалью М.А., Марсиллак С.М., Карчин Р., Манукян С., Грист С., Сваби Р.Ф., Урменьи Т.П., Рондинелли Э., Силва Р., Гайол Л. и др. (2007) Определение риска рака, связанного с миссенс-вариантами BRCA1 зародышевой линии, с помощью функционального анализа. Исследование рака 67(4):1494-501

2006 г.

Пипер У., Эсвар Н., Дэвис Ф., Браберг Х., Мадхусудхан М., Росси А., Марти-Реном М., Карчин Р., Уэбб Б., Эрамиан Д., Шен М., Келли Л., Мело Ф. и Сали А. (2006) MODBASE, база данных аннотированных сравнительных моделей структуры белков и связанных ресурсов. Исследование нуклеиновых кислот 34:D291-5

Карплюс К., Карчин Р., Шакелфорд Г. и Хьюи Р. (2005) Калибровка E-значений для скрытых марковских моделей с использованием нулевых моделей обратной последовательности. Биоинформатика 21(22):4107-15

Карчин Р., Диканс М., Келли Л., Томас Д., Пипер У., Эсвар Н., Хаусслер Д. и Сали А. (2005) LS-SNP: крупномасштабная аннотация кодирования несинонимичных SNP на основе нескольких источников информации. Биоинформатика 21(12):2814-20

Карчин Р., Келли Л. и Сали А. (2005) Улучшение функциональной аннотации несинонимичных SNP с помощью теории информации. Тихоокеанский симпозиум по биокомпьютингу 10:397-408

Карчин Р. , Клайн М. и Карплюс К. (2004) Оценка алфавитов локальной структуры на основе захоронения остатков. Белки 55(3):508-18

Карчин Р., Клайн М., Мандель-Гутфренд Ю. и Карплюс К. (2003) Скрытые марковские модели, которые используют предсказанную локальную структуру для распознавания складок: алфавиты геометрии белкового остова. Белки 51(4):504-514

Karplus K, Karchin R, Draper J, Casper J, Mandel-Gutfreund Y, Diehkans, M & Hughey R (2003) Сочетание методов локальной структуры, распознавания кратности и новой кратности для предсказания структуры белка. Белки 53(S6):491-496

Карчин Р., Карплюс К. и Хаусслер, Д. (2002) Классификация рецепторов, связанных с G-белком, с помощью машин опорных векторов. Биоинформатика 18(1):147-159

Карплюс К., Карчин Р., Барретт С., Ту С., Клайн М., Диканс М. Грейт, Л. Каспер, Дж. и Хьюи Р. (2001) Какова добавленная стоимость вмешательства человека в предсказание структуры белка? Белки 45(S5):86-91

Карчин Р. и Хьюи Р. (1998) Взвешивание скрытых марковских моделей для максимальной дискриминации. Биоинформатика 14(9):772-82 Лаборатория Карчин | Университет Джона Хопкинса | Институт вычислительной медицины

Почему он бьет по рулю во время движения или торможения?

К большому сожалению, почти все автовладельцы уверены, что вибрация и биение руля означают лишь необходимость балансировки колес. На самом деле несбалансированные колеса вызывают вибрацию на руле.

Проблемы с вибрацией могут буквально выйти из строя сами собой. И даже более того – эта неисправность имеет свойство подкрадываться к ничего не подозревающему автовладельцу незаметно. И вот однажды, в какой-то момент, уже очень сильно стучит руль, вибрации отдаются на весь корпус, руль бьется и при движении, и при торможении. Но автовладелец уже привык к этим вибрациям и не спешит на СТО для устранения неисправности. Ну а те, кто столкнулся с этой проблемой и желает в ней разобраться, должны знать причины этих вибраций и биений на руле. На самом деле причин очень много. Зная причины, можно легко и без значительных затрат устранить поломку и таким образом остановить вибрацию.

Метод диагностики

Для проведения точной диагностики необходимо эксплуатировать автомобиль в разных режимах. При движении по трассе с разной скоростью нужно чувствовать удары руля при движении (торможении). Также необходимо помнить, с какой скорости начинаются колебания и на каком заканчиваются. Рекомендуется проверить, как ведет себя машина при разгоне и при торможении – исчезают или усиливаются вибрации.

Нарушение балансировки из-за снега и грязи

Это одна из самых популярных и наиболее вероятных причин, почему чувствуется биение руля. Вибрации могут внезапно появиться, а также прекратиться после разгона. На современных литых дисках грязь увидеть очень легко, а на стальных штампованных уже сложно. В них слишком маленькие вентиляционные отверстия, а декоративная бленда может существенно мешать нормальному просмотру. При ударе по рулю следует искать грязь с внутренней стороны стального штампованного диска.

Бьет только на большой скорости: нарушение балансировки

Шины и диски не идеальны. Они могут быть изначально неравномерными или с неоднородным составом. Так как вес шин и дисков местами может быть разным, при вращении он будет тянуть на себя центр тяжести. Это центробежная сила. При вращении колеса на больших скоростях это усилие обязательно будет отдаваться через тягу на руль. Чтобы избежать таких проблем, необходимо выполнять балансировку колес после любой замены дисков или резины. Суть этого процесса заключается в выравнивании масс колеса в каждой точке с помощью грузов, приклеенных к внутренней или внешней поверхности диска.

Эксплуатация автомобиля, на котором колеса имеют плохой баланс, может спровоцировать сильный износ в некоторых местах шины в течение длительного времени. В результате протектор через 15-20 тысяч километров пробега будет местами «откушен». Использовать такую ​​шину или восстанавливать ее нет смысла. Водитель почувствует, что еще сильнее бьет по рулю во время движения. Также при этом изнашиваются элементы подвески и подшипник ступицы. Все это влечет за собой дорогостоящий ремонт.

Признаки разбалансировки колес

Основными особенностями шин с нарушенной балансировкой являются, конечно же, сильные вибрации при движении на высоких скоростях. Для легковых автомобилей эта скорость превышает 60 километров в час. Если при движении на скорости сильно бьет руль, рекомендуется внимательно осмотреть колеса – на их поверхности не должно быть вмятин и других деформаций. Если автовладелец не ловил во время движения больших ям, покрышки не имеют большого износа, а вибрация только на руле в момент разгона, то, скорее всего, вопрос решается простой балансировкой. Однако не думайте, что решить ситуацию можно только балансировкой передних колес. Проблему вибраций можно победить, только правильно отбалансировав все четыре колеса.

Деформация дисков или шин

В некоторых случаях, если руль бьется при движении, причины могут быть в кривых колесах. Эту проблему легко выявляет любой квалифицированный работник шиномонтажного цеха после тестирования данного колеса на стенде. Он обязательно об этом расскажет. Важно, чтобы автомобилист сам присутствовал в процессе проверки и убедился в отсутствии проблемы.

Однако, если при вращении, наблюдая за одной точкой ребра, видно, что колесо прыгает, это первый признак. Следует определить, прыгает ли диск вместе с шиной. Если да, то причина биений — диск. Если последний не прыгает, значит повреждена сама шина. Большинство дисков гнутся из-за попадания в дорожные ямы. Часто это происходит в весенний период времени. Это можно определить даже без необходимости демонтажа колеса – достаточно осмотреть обод на наличие вмятин. Особое внимание следует уделить внутренней части колеса. Чаще всего используются стальные штампованные диски.

Но не только вмятины могут вызывать вибрации. Руль может быть изогнут сам по себе – даже на подставке он может отлично вращаться, а после установки на автомобиль владелец почувствует, что его, например, «Форд-Фокус» бьет по рулю во время движения. Это явление происходит из-за того, что на стенде колесо закреплено на центральном отверстии, а на автомобиле — через отверстия под гайки или болты. Иногда они не обеспечивают максимальный уровень крепления. И диск может быть не четным.

Изношенные или неисправные шины также часто являются причиной биения руля или вибраций по всему кузову. Среди наиболее частых деформаций – поврежденный шнур, неровности боковых стенок, брак производителя.

Недостаточный уровень давления в колесах

Иногда, но достаточно редко, колесо дергается при езде на ВАЗе или любом другом автомобиле из-за неправильного давления воздуха в шине. Это одна из самых простых причин и диагностировать ее очень легко, а устранить несложно.

Опасная вибрация

Эта неисправность из серии легко устранимых и легко диагностируемых. Часто бьет по рулю при езде из-за ослабления креплений хотя бы одного из колес. Причина на самом деле очень простая, но и очень опасная – если колесо отключится, результат будет плачевным. Что касается ремонта автомобиля, то он будет довольно дорогим. Если вовремя не заметить эту причину, автовладелец приедет на замену тормозных дисков, колесных дисков, ступичных элементов. Вибрации при этом могут возникать с разной скоростью и даже при очень малых, причем цикличность биений соблюдается не всегда.

Рулевые тяги

Очень часто руль сильно бьет при езде (ВАЗ 2109 в том числе) из-за чрезмерно изношенных наконечников, а также сильного выработки на рулевых тягах. Чтобы узнать, так ли это, необходимо проверить сами рулевые тяги на предмет люфта. Затем нужно попросить помощника крепко схватиться за руль и подтянуть руль на поднятом домкратом руле – у них не должно быть свободного хода. Если есть какие-то люфты, или вообще дергание и болтание, то это и есть причина биений. Деталь нужно заменить, а затем – произвести разборку.

Рулевая рейка

Часто бьет руль при движении на любой скорости из-за сильно изношенной рулевой рейки. Если износ большой, то увеличится люфт руля. Для устранения этой неисправности рекомендуется прижать прижимной болт к рейке. Затягивайте до тех пор, пока рулевое колесо не вернется в среднее положение при повороте. Затем ослабьте болт с одной стороны. После этой операции биение уменьшится, а может и вовсе исчезнуть.

Шарикоподшипники

Это одна из возможных причин. В первую очередь нужно убедиться в отсутствии люфта колес на шаровой опоре. Для диагностики машину поднимают на домкрате и поддерживают шар на статической опоре, стоящей на земле. При этом колесо должно быть немного в воздухе. Далее одна рука берется за руль вверху, другая — внизу и катушку колеса. Если есть люфт, то шариковый подшипник изношен и нуждается в замене. После этого вибрации также могут прекратиться. Если они остались, нужно искать дальше.

Если при торможении колесо упирается в тормоз

Когда автовладелец чувствует вибрации или биения только в процессе торможения, то велика вероятность, что проблема кроется в деформациях или каких-либо других проблемах с тормозным барабаном/диском.

Оба вышеперечисленных элемента изменяют свою форму или деформируются из-за сильного износа или перегрева при длительном и достаточно сильном торможении водителем. Также деформация возникает после сильного торможения, а затем попадания в лужу — диск перегрелся и резко остыл. После таких испытаний поверхность детали приобретет волнистую структуру. Барабан изменит свою форму на овальную. Если во время движения вы ударились рулем (ВАЗ 2114 не исключение), то здесь причина в грубой эксплуатации автомобиля. Ремонт в такой ситуации невозможен, и устранить проблему поможет только замена изношенных или деформированных деталей.

Вибрация и сердцебиение на «десятке»

Эти автомобили ничем особенным от других моделей и марок не отличаются. Если вы ударились о руль за рулем ВАЗ-2110, то причина в следующих неисправностях. Среди них можно выделить тормозные колодки, но это большая редкость. И чаще всего после замены колодок проблема возвращается снова. Но проверить их состояние будет не лишним.

Среди нестандартных причин может быть концентратор вибраций. В этом случае ее рекомендуется пробивать на токарном станке или непосредственно на автомобиле с помощью специальных инструментов.

Кроме того, причиной вибраций на руле или кузове может быть ШРУС, который просто развалился. При этом удары ощущаются при разгоне, а при разгоне автомобиля вибрации пропадают. На малой скорости их нет. Помимо побоев, также может быть слышен сильный шум.

Резюме

Необходимо помнить, что автомобиль – это цельный механизм, где одна неисправность может спровоцировать массу других проблем. Если появилось биение на руле, нужно сразу искать причину и устранять неисправность. Ездить с такими вибрациями просто опасно. Как видите, проблема полностью решена.